Protein–RNA interactions for Protein: Q06685

VIP1, Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIP1Q06685 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.35■■□□□ 1.33
VIP1Q06685 NSR1YGR159C 1245 nt23.03■■□□□ 1.28
VIP1Q06685 NOP1YDL014W 984 nt22.74■■□□□ 1.23
VIP1Q06685 YKL036CYKL036C 393 nt21.13■□□□□ 0.97
VIP1Q06685 MDJ1YFL016C 1536 nt20.33■□□□□ 0.85
VIP1Q06685 Q0297Q0297 156 nt19.94■□□□□ 0.78
VIP1Q06685 SRX1YKL086W 384 nt19.86■□□□□ 0.77
VIP1Q06685 YJL027CYJL027C 417 nt19.75■□□□□ 0.75
VIP1Q06685 SCS3YGL126W 1143 nt19.3■□□□□ 0.68
VIP1Q06685 YCR051WYCR051W 669 nt18.88■□□□□ 0.61
VIP1Q06685 YOL085CYOL085C 342 nt18.28■□□□□ 0.52
VIP1Q06685 DBP2YNL112W 1641 nt18.02■□□□□ 0.48
VIP1Q06685 PKP1YIL042C 1185 nt18.01■□□□□ 0.47
VIP1Q06685 RPP1BYDL130W 321 nt17.9■□□□□ 0.46
VIP1Q06685 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.87■□□□□ 0.45
VIP1Q06685 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.87■□□□□ 0.45
VIP1Q06685 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.87■□□□□ 0.45
VIP1Q06685 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.87■□□□□ 0.45
VIP1Q06685 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.87■□□□□ 0.45
VIP1Q06685 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.87■□□□□ 0.45
VIP1Q06685 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.87■□□□□ 0.45
VIP1Q06685 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.87■□□□□ 0.45
VIP1Q06685 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.87■□□□□ 0.45
VIP1Q06685 CCC1YLR220W 969 nt17.7■□□□□ 0.42
VIP1Q06685 ATS1YAL020C 1002 nt17.3■□□□□ 0.36
VIP1Q06685 SCJ1YMR214W 1134 nt17.28■□□□□ 0.36
VIP1Q06685 YBR190WYBR190W 312 nt17.28■□□□□ 0.36
VIP1Q06685 PET122YER153C 765 nt17.1■□□□□ 0.33
VIP1Q06685 RVS167YDR388W 1449 nt17.01■□□□□ 0.31
VIP1Q06685 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.96■□□□□ 0.31
VIP1Q06685 SCR1SCR1 522 nt16.96■□□□□ 0.31
VIP1Q06685 RTC3YHR087W 336 nt16.92■□□□□ 0.3
VIP1Q06685 RRN5YLR141W 1092 nt16.61■□□□□ 0.25
VIP1Q06685 SHR5YOL110W 714 nt16.45■□□□□ 0.22
VIP1Q06685 YDJ1YNL064C 1230 nt16.4■□□□□ 0.22
VIP1Q06685 RSB1YOR049C 1065 nt16.33■□□□□ 0.2
VIP1Q06685 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.28■□□□□ 0.2
VIP1Q06685 GAR1YHR089C 618 nt16.02■□□□□ 0.16
VIP1Q06685 PST2YDR032C 597 nt15.98■□□□□ 0.15
VIP1Q06685 DEP1YAL013W 1218 nt15.94■□□□□ 0.14
VIP1Q06685 URN1YPR152C 1398 nt15.9■□□□□ 0.14
VIP1Q06685 RPN10YHR200W 807 nt15.71■□□□□ 0.11
VIP1Q06685 YNL208WYNL208W 600 nt15.7■□□□□ 0.1
VIP1Q06685 OPI9YLR338W 858 nt15.63■□□□□ 0.09
VIP1Q06685 PUT4YOR348C 1884 nt15.56■□□□□ 0.08
VIP1Q06685 SAH1YER043C 1350 nt15.49■□□□□ 0.07
VIP1Q06685 TIR1YER011W 765 nt15.48■□□□□ 0.07
VIP1Q06685 YKL097CYKL097C 411 nt15.46■□□□□ 0.07
VIP1Q06685 ARE1YCR048W 1833 nt15.33■□□□□ 0.05
VIP1Q06685 SHU1YHL006C 453 nt15.31■□□□□ 0.04
VIP1Q06685 SSA1YAL005C 1929 nt15.25■□□□□ 0.03
VIP1Q06685 YJR018WYJR018W 363 nt15.18■□□□□ 0.02
VIP1Q06685 PUN1YLR414C 792 nt15.18■□□□□ 0.02
VIP1Q06685 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.16■□□□□ 0.02
VIP1Q06685 SSA3YBL075C 1950 nt15.12■□□□□ 0.01
VIP1Q06685 POA1YBR022W 534 nt15.1■□□□□ 0.01
VIP1Q06685 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.03■□□□□ -0
VIP1Q06685 SRB2YHR041C 633 nt15.02■□□□□ -0
VIP1Q06685 YJR120WYJR120W 351 nt14.96□□□□□ -0.01
VIP1Q06685 PTC2YER089C 1395 nt14.96□□□□□ -0.02
VIP1Q06685 RPP2BYDR382W 333 nt14.92□□□□□ -0.02
VIP1Q06685 BUD23YCR047C 828 nt14.83□□□□□ -0.04
VIP1Q06685 WWM1YFL010C 636 nt14.82□□□□□ -0.04
VIP1Q06685 YGR021WYGR021W 873 nt14.79□□□□□ -0.04
VIP1Q06685 YOR139CYOR139C 393 nt14.79□□□□□ -0.04
VIP1Q06685 NAB2YGL122C 1578 nt14.75□□□□□ -0.05
VIP1Q06685 BSC6YOL137W 1494 nt14.75□□□□□ -0.05
VIP1Q06685 HOM6YJR139C 1080 nt14.74□□□□□ -0.05
VIP1Q06685 MNP1YGL068W 585 nt14.71□□□□□ -0.05
VIP1Q06685 NPL3YDR432W 1245 nt14.66□□□□□ -0.06
VIP1Q06685 BDH2YAL061W 1254 nt14.64□□□□□ -0.07
VIP1Q06685 INM2YDR287W 879 nt14.61□□□□□ -0.07
VIP1Q06685 DAL1YIR027C 1383 nt14.6□□□□□ -0.07
VIP1Q06685 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.58□□□□□ -0.08
VIP1Q06685 FPR4YLR449W 1179 nt14.58□□□□□ -0.08
VIP1Q06685 FIS1YIL065C 468 nt14.56□□□□□ -0.08
VIP1Q06685 RKM5YLR137W 1104 nt14.53□□□□□ -0.08
VIP1Q06685 YOL037CYOL037C 354 nt14.52□□□□□ -0.09
VIP1Q06685 YBL100CYBL100C 315 nt14.51□□□□□ -0.09
VIP1Q06685 LSM3YLR438C-A 270 nt14.46□□□□□ -0.09
VIP1Q06685 PHO4YFR034C 939 nt14.45□□□□□ -0.1
VIP1Q06685 FUN26YAL022C 1554 nt14.34□□□□□ -0.11
VIP1Q06685 TRM9YML014W 840 nt14.33□□□□□ -0.12
VIP1Q06685 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.2□□□□□ -0.14
VIP1Q06685 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.2□□□□□ -0.14
VIP1Q06685 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.2□□□□□ -0.14
VIP1Q06685 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.2□□□□□ -0.14
VIP1Q06685 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.2□□□□□ -0.14
VIP1Q06685 CCT6YDR188W 1641 nt14.18□□□□□ -0.14
VIP1Q06685 YLR281CYLR281C 468 nt14.15□□□□□ -0.14
VIP1Q06685 ALF1YNL148C 765 nt14.11□□□□□ -0.15
VIP1Q06685 YPS1YLR120C 1710 nt14.1□□□□□ -0.15
VIP1Q06685 WHI5YOR083W 888 nt14.09□□□□□ -0.15
VIP1Q06685 PUS2YGL063W 1113 nt14.08□□□□□ -0.16
VIP1Q06685 YDR095CYDR095C 411 nt14.05□□□□□ -0.16
VIP1Q06685 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.05□□□□□ -0.16
VIP1Q06685 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.05□□□□□ -0.16
VIP1Q06685 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.96□□□□□ -0.17
VIP1Q06685 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.96□□□□□ -0.17
VIP1Q06685 SPT5YML010W 3192 nt13.88□□□□□ -0.19
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