Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.29■■□□□ 1.48
GEF1P37020 NSR1YGR159C 1245 nt23.89■■□□□ 1.41
GEF1P37020 NOP1YDL014W 984 nt23.68■■□□□ 1.38
GEF1P37020 YKL036CYKL036C 393 nt21.98■■□□□ 1.11
GEF1P37020 MDJ1YFL016C 1536 nt21.09■□□□□ 0.97
GEF1P37020 Q0297Q0297 156 nt20.68■□□□□ 0.9
GEF1P37020 SRX1YKL086W 384 nt20.62■□□□□ 0.89
GEF1P37020 YJL027CYJL027C 417 nt20.6■□□□□ 0.89
GEF1P37020 SCS3YGL126W 1143 nt20.05■□□□□ 0.8
GEF1P37020 YCR051WYCR051W 669 nt19.68■□□□□ 0.74
GEF1P37020 YOL085CYOL085C 342 nt18.99■□□□□ 0.63
GEF1P37020 PKP1YIL042C 1185 nt18.75■□□□□ 0.59
GEF1P37020 DBP2YNL112W 1641 nt18.6■□□□□ 0.57
GEF1P37020 RPP1BYDL130W 321 nt18.59■□□□□ 0.57
GEF1P37020 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.51■□□□□ 0.55
GEF1P37020 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.51■□□□□ 0.55
GEF1P37020 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.51■□□□□ 0.55
GEF1P37020 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.51■□□□□ 0.55
GEF1P37020 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.51■□□□□ 0.55
GEF1P37020 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.51■□□□□ 0.55
GEF1P37020 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.51■□□□□ 0.55
GEF1P37020 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.51■□□□□ 0.55
GEF1P37020 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.51■□□□□ 0.55
GEF1P37020 CCC1YLR220W 969 nt18.47■□□□□ 0.55
GEF1P37020 ATS1YAL020C 1002 nt17.97■□□□□ 0.47
GEF1P37020 SCJ1YMR214W 1134 nt17.94■□□□□ 0.46
GEF1P37020 YBR190WYBR190W 312 nt17.9■□□□□ 0.46
GEF1P37020 PET122YER153C 765 nt17.75■□□□□ 0.43
GEF1P37020 RVS167YDR388W 1449 nt17.74■□□□□ 0.43
GEF1P37020 SCR1SCR1 522 nt17.7■□□□□ 0.42
GEF1P37020 RTC3YHR087W 336 nt17.66■□□□□ 0.42
GEF1P37020 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.61■□□□□ 0.41
GEF1P37020 Q0182Q0182 405 nt17.37■□□□□ 0.37
GEF1P37020 RRN5YLR141W 1092 nt17.26■□□□□ 0.35
GEF1P37020 SHR5YOL110W 714 nt17.07■□□□□ 0.32
GEF1P37020 RSB1YOR049C 1065 nt17.04■□□□□ 0.32
GEF1P37020 YDJ1YNL064C 1230 nt17■□□□□ 0.31
GEF1P37020 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.9■□□□□ 0.3
GEF1P37020 MOT3YMR070W 1473 nt16.9■□□□□ 0.3
GEF1P37020 GAR1YHR089C 618 nt16.68■□□□□ 0.26
GEF1P37020 DEP1YAL013W 1218 nt16.59■□□□□ 0.25
GEF1P37020 PST2YDR032C 597 nt16.57■□□□□ 0.24
GEF1P37020 URN1YPR152C 1398 nt16.51■□□□□ 0.23
GEF1P37020 RPN10YHR200W 807 nt16.37■□□□□ 0.21
GEF1P37020 YNL208WYNL208W 600 nt16.32■□□□□ 0.2
GEF1P37020 OPI9YLR338W 858 nt16.17■□□□□ 0.18
GEF1P37020 YKL097CYKL097C 411 nt16.12■□□□□ 0.17
GEF1P37020 TIR1YER011W 765 nt16.08■□□□□ 0.16
GEF1P37020 SAH1YER043C 1350 nt16.06■□□□□ 0.16
GEF1P37020 PUT4YOR348C 1884 nt16.04■□□□□ 0.16
GEF1P37020 SHU1YHL006C 453 nt15.88■□□□□ 0.13
GEF1P37020 ARE1YCR048W 1833 nt15.82■□□□□ 0.12
GEF1P37020 SSA1YAL005C 1929 nt15.79■□□□□ 0.12
GEF1P37020 YJR018WYJR018W 363 nt15.76■□□□□ 0.11
GEF1P37020 PUN1YLR414C 792 nt15.76■□□□□ 0.11
GEF1P37020 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.71■□□□□ 0.11
GEF1P37020 POA1YBR022W 534 nt15.66■□□□□ 0.1
GEF1P37020 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.65■□□□□ 0.1
GEF1P37020 RPP2BYDR382W 333 nt15.57■□□□□ 0.08
GEF1P37020 PTC2YER089C 1395 nt15.54■□□□□ 0.08
GEF1P37020 SRB2YHR041C 633 nt15.49■□□□□ 0.07
GEF1P37020 BUD23YCR047C 828 nt15.45■□□□□ 0.06
GEF1P37020 YJR120WYJR120W 351 nt15.41■□□□□ 0.06
GEF1P37020 WWM1YFL010C 636 nt15.39■□□□□ 0.05
GEF1P37020 YGR021WYGR021W 873 nt15.39■□□□□ 0.05
GEF1P37020 YOR139CYOR139C 393 nt15.32■□□□□ 0.04
GEF1P37020 NPL3YDR432W 1245 nt15.31■□□□□ 0.04
GEF1P37020 NAB2YGL122C 1578 nt15.3■□□□□ 0.04
GEF1P37020 MNP1YGL068W 585 nt15.27■□□□□ 0.04
GEF1P37020 HOM6YJR139C 1080 nt15.27■□□□□ 0.04
GEF1P37020 BSC6YOL137W 1494 nt15.26■□□□□ 0.03
GEF1P37020 FPR4YLR449W 1179 nt15.23■□□□□ 0.03
GEF1P37020 BDH2YAL061W 1254 nt15.19■□□□□ 0.02
GEF1P37020 INM2YDR287W 879 nt15.18■□□□□ 0.02
GEF1P37020 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.14■□□□□ 0.01
GEF1P37020 DAL1YIR027C 1383 nt15.13■□□□□ 0.01
GEF1P37020 YOL037CYOL037C 354 nt15.09■□□□□ 0.01
GEF1P37020 YBL100CYBL100C 315 nt15.08■□□□□ 0
GEF1P37020 RKM5YLR137W 1104 nt15.07■□□□□ 0
GEF1P37020 FIS1YIL065C 468 nt15.03■□□□□ -0
GEF1P37020 LSM3YLR438C-A 270 nt15.01□□□□□ -0.01
GEF1P37020 PHO4YFR034C 939 nt14.98□□□□□ -0.01
GEF1P37020 TRM9YML014W 840 nt14.94□□□□□ -0.02
GEF1P37020 SSA3YBL075C 1950 nt14.89□□□□□ -0.03
GEF1P37020 FUN26YAL022C 1554 nt14.88□□□□□ -0.03
GEF1P37020 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.73□□□□□ -0.05
GEF1P37020 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.73□□□□□ -0.05
GEF1P37020 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.73□□□□□ -0.05
GEF1P37020 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.73□□□□□ -0.05
GEF1P37020 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.73□□□□□ -0.05
GEF1P37020 ALF1YNL148C 765 nt14.73□□□□□ -0.05
GEF1P37020 CCT6YDR188W 1641 nt14.68□□□□□ -0.06
GEF1P37020 PUS2YGL063W 1113 nt14.67□□□□□ -0.06
GEF1P37020 YLR281CYLR281C 468 nt14.67□□□□□ -0.06
GEF1P37020 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.65□□□□□ -0.06
GEF1P37020 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.65□□□□□ -0.06
GEF1P37020 WHI5YOR083W 888 nt14.65□□□□□ -0.06
GEF1P37020 YPS1YLR120C 1710 nt14.58□□□□□ -0.08
GEF1P37020 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.53□□□□□ -0.08
GEF1P37020 YDR095CYDR095C 411 nt14.52□□□□□ -0.09
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