Protein–RNA interactions for Protein: Q05510

YDR344C, Uncharacterized protein YDR344C, yeastyeast

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR344CQ05510 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.29■■□□□ 1
YDR344CQ05510 NOP1YDL014W 984 nt20.88■□□□□ 0.93
YDR344CQ05510 NSR1YGR159C 1245 nt20.63■□□□□ 0.89
YDR344CQ05510 YKL036CYKL036C 393 nt19.72■□□□□ 0.75
YDR344CQ05510 YJL027CYJL027C 417 nt18.54■□□□□ 0.56
YDR344CQ05510 Q0297Q0297 156 nt18.38■□□□□ 0.53
YDR344CQ05510 SRX1YKL086W 384 nt18.2■□□□□ 0.5
YDR344CQ05510 SCS3YGL126W 1143 nt18.19■□□□□ 0.5
YDR344CQ05510 MDJ1YFL016C 1536 nt17.89■□□□□ 0.45
YDR344CQ05510 YCR051WYCR051W 669 nt17.4■□□□□ 0.38
YDR344CQ05510 YOL085CYOL085C 342 nt17.04■□□□□ 0.32
YDR344CQ05510 PKP1YIL042C 1185 nt16.79■□□□□ 0.28
YDR344CQ05510 SCJ1YMR214W 1134 nt16.7■□□□□ 0.26
YDR344CQ05510 RPP1BYDL130W 321 nt16.52■□□□□ 0.24
YDR344CQ05510 ATS1YAL020C 1002 nt16.4■□□□□ 0.22
YDR344CQ05510 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.14■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.14■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.14■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.14■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.14■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.14■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.14■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.14■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.14■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 CCC1YLR220W 969 nt16.1■□□□□ 0.17
YDR344CQ05510 DBP2YNL112W 1641 nt15.94■□□□□ 0.14
YDR344CQ05510 SCR1SCR1 522 nt15.75■□□□□ 0.11
YDR344CQ05510 PET122YER153C 765 nt15.73■□□□□ 0.11
YDR344CQ05510 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YDR344CQ05510 YGR139WYGR139W 339 nt15.36■□□□□ 0.05
YDR344CQ05510 RRN5YLR141W 1092 nt15.34■□□□□ 0.05
YDR344CQ05510 RTC3YHR087W 336 nt15.28■□□□□ 0.04
YDR344CQ05510 RSB1YOR049C 1065 nt15.23■□□□□ 0.03
YDR344CQ05510 RVS167YDR388W 1449 nt15.23■□□□□ 0.03
YDR344CQ05510 YBR190WYBR190W 312 nt15.09■□□□□ 0.01
YDR344CQ05510 PST2YDR032C 597 nt15.07■□□□□ 0
YDR344CQ05510 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.02■□□□□ -0
YDR344CQ05510 YDJ1YNL064C 1230 nt14.93□□□□□ -0.02
YDR344CQ05510 YKL097CYKL097C 411 nt14.82□□□□□ -0.04
YDR344CQ05510 SHR5YOL110W 714 nt14.77□□□□□ -0.05
YDR344CQ05510 GAR1YHR089C 618 nt14.59□□□□□ -0.07
YDR344CQ05510 VAR1Q0140 1197 nt14.54□□□□□ -0.08
YDR344CQ05510 SHU1YHL006C 453 nt14.37□□□□□ -0.11
YDR344CQ05510 DEP1YAL013W 1218 nt14.25□□□□□ -0.13
YDR344CQ05510 YOR139CYOR139C 393 nt14.07□□□□□ -0.16
YDR344CQ05510 URN1YPR152C 1398 nt14.07□□□□□ -0.16
YDR344CQ05510 TIR1YER011W 765 nt14.05□□□□□ -0.16
YDR344CQ05510 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.04□□□□□ -0.16
YDR344CQ05510 YNL208WYNL208W 600 nt14.03□□□□□ -0.16
YDR344CQ05510 RPN10YHR200W 807 nt14□□□□□ -0.17
YDR344CQ05510 MOT3YMR070W 1473 nt13.97□□□□□ -0.17
YDR344CQ05510 NPL3YDR432W 1245 nt13.92□□□□□ -0.18
YDR344CQ05510 YDR509WYDR509W 348 nt13.87□□□□□ -0.19
YDR344CQ05510 NME1NME1 340 nt13.81□□□□□ -0.2
YDR344CQ05510 SSA1YAL005C 1929 nt13.74□□□□□ -0.21
YDR344CQ05510 OPI9YLR338W 858 nt13.72□□□□□ -0.21
YDR344CQ05510 CSM2YIL132C 642 nt13.71□□□□□ -0.21
YDR344CQ05510 PAU21YOR394W 495 nt13.64□□□□□ -0.23
YDR344CQ05510 PAU22YPL282C 495 nt13.64□□□□□ -0.23
YDR344CQ05510 Q0182Q0182 405 nt13.61□□□□□ -0.23
YDR344CQ05510 MNP1YGL068W 585 nt13.59□□□□□ -0.23
YDR344CQ05510 YGR021WYGR021W 873 nt13.59□□□□□ -0.23
YDR344CQ05510 SRB2YHR041C 633 nt13.58□□□□□ -0.24
YDR344CQ05510 YOL037CYOL037C 354 nt13.55□□□□□ -0.24
YDR344CQ05510 HOM6YJR139C 1080 nt13.53□□□□□ -0.24
YDR344CQ05510 SAH1YER043C 1350 nt13.53□□□□□ -0.24
YDR344CQ05510 WWM1YFL010C 636 nt13.52□□□□□ -0.25
YDR344CQ05510 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YDR344CQ05510 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YDR344CQ05510 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YDR344CQ05510 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YDR344CQ05510 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.48□□□□□ -0.25
YDR344CQ05510 YJR018WYJR018W 363 nt13.45□□□□□ -0.26
YDR344CQ05510 ARO7YPR060C 771 nt13.45□□□□□ -0.26
YDR344CQ05510 PAM17YKR065C 594 nt13.44□□□□□ -0.26
YDR344CQ05510 RPP2BYDR382W 333 nt13.36□□□□□ -0.27
YDR344CQ05510 PUN1YLR414C 792 nt13.36□□□□□ -0.27
YDR344CQ05510 RKM5YLR137W 1104 nt13.35□□□□□ -0.27
YDR344CQ05510 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.27□□□□□ -0.29
YDR344CQ05510 PUS2YGL063W 1113 nt13.27□□□□□ -0.29
YDR344CQ05510 YJR120WYJR120W 351 nt13.26□□□□□ -0.29
YDR344CQ05510 Q0017Q0017 162 nt13.26□□□□□ -0.29
YDR344CQ05510 PUT4YOR348C 1884 nt13.25□□□□□ -0.29
YDR344CQ05510 Q0142Q0142 177 nt13.23□□□□□ -0.29
YDR344CQ05510 Q0144Q0144 330 nt13.19□□□□□ -0.3
YDR344CQ05510 ARE1YCR048W 1833 nt13.18□□□□□ -0.3
YDR344CQ05510 REG2YBR050C 1017 nt13.18□□□□□ -0.3
YDR344CQ05510 YLR281CYLR281C 468 nt13.17□□□□□ -0.3
YDR344CQ05510 BMT5YIL096C 1011 nt13.15□□□□□ -0.3
YDR344CQ05510 BSC6YOL137W 1494 nt13.14□□□□□ -0.31
YDR344CQ05510 PTC2YER089C 1395 nt13.11□□□□□ -0.31
YDR344CQ05510 BDH2YAL061W 1254 nt13.11□□□□□ -0.31
YDR344CQ05510 BUR6YER159C 429 nt13.09□□□□□ -0.31
YDR344CQ05510 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.09□□□□□ -0.31
YDR344CQ05510 WHI5YOR083W 888 nt13.09□□□□□ -0.31
YDR344CQ05510 SEM1YDR363W-A 270 nt13.06□□□□□ -0.32
YDR344CQ05510 LSM3YLR438C-A 270 nt13.03□□□□□ -0.32
YDR344CQ05510 SSA3YBL075C 1950 nt12.99□□□□□ -0.33
YDR344CQ05510 POA1YBR022W 534 nt12.96□□□□□ -0.33
YDR344CQ05510 FMP45YDL222C 930 nt12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.5 ms