Protein–RNA interactions for Protein: P32074

SEC21, Coatomer subunit gamma, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC21P32074 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.84■■□□□ 1.09
SEC21P32074 NSR1YGR159C 1245 nt21.66■■□□□ 1.06
SEC21P32074 NOP1YDL014W 984 nt21.44■■□□□ 1.02
SEC21P32074 YKL036CYKL036C 393 nt20.13■□□□□ 0.81
SEC21P32074 MDJ1YFL016C 1536 nt19.41■□□□□ 0.7
SEC21P32074 Q0297Q0297 156 nt18.88■□□□□ 0.61
SEC21P32074 YJL027CYJL027C 417 nt18.87■□□□□ 0.61
SEC21P32074 SRX1YKL086W 384 nt18.72■□□□□ 0.59
SEC21P32074 SCS3YGL126W 1143 nt18.49■□□□□ 0.55
SEC21P32074 YCR051WYCR051W 669 nt17.78■□□□□ 0.44
SEC21P32074 YOL085CYOL085C 342 nt17.42■□□□□ 0.38
SEC21P32074 PKP1YIL042C 1185 nt17.08■□□□□ 0.32
SEC21P32074 DBP2YNL112W 1641 nt17.03■□□□□ 0.32
SEC21P32074 RPP1BYDL130W 321 nt16.94■□□□□ 0.3
SEC21P32074 SCJ1YMR214W 1134 nt16.93■□□□□ 0.3
SEC21P32074 ATS1YAL020C 1002 nt16.68■□□□□ 0.26
SEC21P32074 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC21P32074 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC21P32074 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC21P32074 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC21P32074 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC21P32074 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC21P32074 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC21P32074 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC21P32074 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.67■□□□□ 0.26
SEC21P32074 CCC1YLR220W 969 nt16.57■□□□□ 0.24
SEC21P32074 YBR190WYBR190W 312 nt16.57■□□□□ 0.24
SEC21P32074 RTC3YHR087W 336 nt16.26■□□□□ 0.19
SEC21P32074 PET122YER153C 765 nt16.11■□□□□ 0.17
SEC21P32074 RVS167YDR388W 1449 nt16.11■□□□□ 0.17
SEC21P32074 SCR1SCR1 522 nt16.09■□□□□ 0.17
SEC21P32074 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.91■□□□□ 0.14
SEC21P32074 RRN5YLR141W 1092 nt15.71■□□□□ 0.11
SEC21P32074 RSB1YOR049C 1065 nt15.5■□□□□ 0.07
SEC21P32074 SHR5YOL110W 714 nt15.46■□□□□ 0.07
SEC21P32074 YDJ1YNL064C 1230 nt15.42■□□□□ 0.06
SEC21P32074 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.41■□□□□ 0.06
SEC21P32074 PST2YDR032C 597 nt15.38■□□□□ 0.05
SEC21P32074 URN1YPR152C 1398 nt15.12■□□□□ 0.01
SEC21P32074 PUT4YOR348C 1884 nt15.12■□□□□ 0.01
SEC21P32074 DEP1YAL013W 1218 nt15.1■□□□□ 0.01
SEC21P32074 SSA3YBL075C 1950 nt15□□□□□ -0.01
SEC21P32074 GAR1YHR089C 618 nt14.98□□□□□ -0.01
SEC21P32074 YKL097CYKL097C 411 nt14.98□□□□□ -0.01
SEC21P32074 RPN10YHR200W 807 nt14.91□□□□□ -0.02
SEC21P32074 OPI9YLR338W 858 nt14.91□□□□□ -0.02
SEC21P32074 SAH1YER043C 1350 nt14.86□□□□□ -0.03
SEC21P32074 YNL208WYNL208W 600 nt14.84□□□□□ -0.03
SEC21P32074 ARE1YCR048W 1833 nt14.81□□□□□ -0.04
SEC21P32074 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.69□□□□□ -0.06
SEC21P32074 POA1YBR022W 534 nt14.69□□□□□ -0.06
SEC21P32074 SHU1YHL006C 453 nt14.64□□□□□ -0.07
SEC21P32074 PUN1YLR414C 792 nt14.5□□□□□ -0.09
SEC21P32074 TIR1YER011W 765 nt14.46□□□□□ -0.09
SEC21P32074 YJR018WYJR018W 363 nt14.41□□□□□ -0.1
SEC21P32074 BSC6YOL137W 1494 nt14.39□□□□□ -0.11
SEC21P32074 BUD23YCR047C 828 nt14.36□□□□□ -0.11
SEC21P32074 PTC2YER089C 1395 nt14.35□□□□□ -0.11
SEC21P32074 YOR139CYOR139C 393 nt14.29□□□□□ -0.12
SEC21P32074 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.28□□□□□ -0.12
SEC21P32074 SSA1YAL005C 1929 nt14.25□□□□□ -0.13
SEC21P32074 NAB2YGL122C 1578 nt14.17□□□□□ -0.14
SEC21P32074 RPP2BYDR382W 333 nt14.13□□□□□ -0.15
SEC21P32074 NPL3YDR432W 1245 nt14.1□□□□□ -0.15
SEC21P32074 YJR120WYJR120W 351 nt14.09□□□□□ -0.15
SEC21P32074 FPR4YLR449W 1179 nt14□□□□□ -0.17
SEC21P32074 SRB2YHR041C 633 nt13.99□□□□□ -0.17
SEC21P32074 DAL1YIR027C 1383 nt13.97□□□□□ -0.17
SEC21P32074 YGR021WYGR021W 873 nt13.96□□□□□ -0.17
SEC21P32074 FIS1YIL065C 468 nt13.95□□□□□ -0.18
SEC21P32074 INM2YDR287W 879 nt13.91□□□□□ -0.18
SEC21P32074 HOM6YJR139C 1080 nt13.91□□□□□ -0.18
SEC21P32074 WWM1YFL010C 636 nt13.88□□□□□ -0.19
SEC21P32074 MNP1YGL068W 585 nt13.86□□□□□ -0.19
SEC21P32074 PHO4YFR034C 939 nt13.84□□□□□ -0.19
SEC21P32074 YOL037CYOL037C 354 nt13.84□□□□□ -0.19
SEC21P32074 YBL100CYBL100C 315 nt13.79□□□□□ -0.2
SEC21P32074 BDH2YAL061W 1254 nt13.77□□□□□ -0.21
SEC21P32074 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SEC21P32074 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SEC21P32074 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SEC21P32074 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SEC21P32074 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.72□□□□□ -0.21
SEC21P32074 RKM5YLR137W 1104 nt13.7□□□□□ -0.22
SEC21P32074 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.68□□□□□ -0.22
SEC21P32074 SPT5YML010W 3192 nt13.67□□□□□ -0.22
SEC21P32074 FUN26YAL022C 1554 nt13.59□□□□□ -0.23
SEC21P32074 YPS1YLR120C 1710 nt13.59□□□□□ -0.23
SEC21P32074 LSM3YLR438C-A 270 nt13.56□□□□□ -0.24
SEC21P32074 TRM9YML014W 840 nt13.56□□□□□ -0.24
SEC21P32074 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.52□□□□□ -0.25
SEC21P32074 MEP2YNL142W 1500 nt13.5□□□□□ -0.25
SEC21P32074 ALF1YNL148C 765 nt13.49□□□□□ -0.25
SEC21P32074 YDR095CYDR095C 411 nt13.48□□□□□ -0.25
SEC21P32074 PUS2YGL063W 1113 nt13.48□□□□□ -0.25
SEC21P32074 YLR281CYLR281C 468 nt13.48□□□□□ -0.25
SEC21P32074 CCT6YDR188W 1641 nt13.39□□□□□ -0.27
SEC21P32074 WHI5YOR083W 888 nt13.38□□□□□ -0.27
SEC21P32074 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.35□□□□□ -0.27
SEC21P32074 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.35□□□□□ -0.27
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