Protein–RNA interactions for Protein: P39102

XDJ1, DnaJ protein homolog XDJ1, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XDJ1P39102 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.9■■□□□ 1.1
XDJ1P39102 NSR1YGR159C 1245 nt21.51■■□□□ 1.03
XDJ1P39102 NOP1YDL014W 984 nt21.45■■□□□ 1.02
XDJ1P39102 YKL036CYKL036C 393 nt20.12■□□□□ 0.81
XDJ1P39102 Q0297Q0297 156 nt18.92■□□□□ 0.62
XDJ1P39102 YJL027CYJL027C 417 nt18.83■□□□□ 0.6
XDJ1P39102 SRX1YKL086W 384 nt18.76■□□□□ 0.59
XDJ1P39102 MDJ1YFL016C 1536 nt18.73■□□□□ 0.59
XDJ1P39102 SCS3YGL126W 1143 nt18.48■□□□□ 0.55
XDJ1P39102 YCR051WYCR051W 669 nt17.79■□□□□ 0.44
XDJ1P39102 YOL085CYOL085C 342 nt17.42■□□□□ 0.38
XDJ1P39102 PKP1YIL042C 1185 nt17.08■□□□□ 0.32
XDJ1P39102 RPP1BYDL130W 321 nt16.96■□□□□ 0.31
XDJ1P39102 SCJ1YMR214W 1134 nt16.85■□□□□ 0.29
XDJ1P39102 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.76■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.76■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.76■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.76■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.76■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.76■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.76■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.76■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.76■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 DBP2YNL112W 1641 nt16.74■□□□□ 0.27
XDJ1P39102 ATS1YAL020C 1002 nt16.64■□□□□ 0.25
XDJ1P39102 CCC1YLR220W 969 nt16.55■□□□□ 0.24
XDJ1P39102 PET122YER153C 765 nt16.15■□□□□ 0.18
XDJ1P39102 SCR1SCR1 522 nt16.07■□□□□ 0.16
XDJ1P39102 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.96■□□□□ 0.15
XDJ1P39102 YBR190WYBR190W 312 nt15.91■□□□□ 0.14
XDJ1P39102 RVS167YDR388W 1449 nt15.8■□□□□ 0.12
XDJ1P39102 RRN5YLR141W 1092 nt15.73■□□□□ 0.11
XDJ1P39102 RTC3YHR087W 336 nt15.53■□□□□ 0.08
XDJ1P39102 RSB1YOR049C 1065 nt15.48■□□□□ 0.07
XDJ1P39102 YDJ1YNL064C 1230 nt15.46■□□□□ 0.07
XDJ1P39102 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.42■□□□□ 0.06
XDJ1P39102 PST2YDR032C 597 nt15.36■□□□□ 0.05
XDJ1P39102 SHR5YOL110W 714 nt15.35■□□□□ 0.05
XDJ1P39102 GAR1YHR089C 618 nt15.02■□□□□ -0
XDJ1P39102 YKL097CYKL097C 411 nt14.91□□□□□ -0.02
XDJ1P39102 YGR139WYGR139W 339 nt14.8□□□□□ -0.04
XDJ1P39102 DEP1YAL013W 1218 nt14.76□□□□□ -0.05
XDJ1P39102 URN1YPR152C 1398 nt14.69□□□□□ -0.06
XDJ1P39102 VAR1Q0140 1197 nt14.64□□□□□ -0.07
XDJ1P39102 SHU1YHL006C 453 nt14.64□□□□□ -0.07
XDJ1P39102 YNL208WYNL208W 600 nt14.6□□□□□ -0.07
XDJ1P39102 RPN10YHR200W 807 nt14.56□□□□□ -0.08
XDJ1P39102 TIR1YER011W 765 nt14.51□□□□□ -0.09
XDJ1P39102 OPI9YLR338W 858 nt14.42□□□□□ -0.1
XDJ1P39102 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.28□□□□□ -0.12
XDJ1P39102 YOR139CYOR139C 393 nt14.27□□□□□ -0.13
XDJ1P39102 SSA1YAL005C 1929 nt14.27□□□□□ -0.13
XDJ1P39102 PUT4YOR348C 1884 nt14.24□□□□□ -0.13
XDJ1P39102 SAH1YER043C 1350 nt14.22□□□□□ -0.13
XDJ1P39102 SRB2YHR041C 633 nt14.1□□□□□ -0.15
XDJ1P39102 NPL3YDR432W 1245 nt14.05□□□□□ -0.16
XDJ1P39102 YJR018WYJR018W 363 nt14.04□□□□□ -0.16
XDJ1P39102 ARE1YCR048W 1833 nt14.03□□□□□ -0.16
XDJ1P39102 PUN1YLR414C 792 nt14.01□□□□□ -0.17
XDJ1P39102 YGR021WYGR021W 873 nt13.97□□□□□ -0.17
XDJ1P39102 HOM6YJR139C 1080 nt13.95□□□□□ -0.18
XDJ1P39102 WWM1YFL010C 636 nt13.93□□□□□ -0.18
XDJ1P39102 YJR120WYJR120W 351 nt13.92□□□□□ -0.18
XDJ1P39102 MNP1YGL068W 585 nt13.9□□□□□ -0.18
XDJ1P39102 RPP2BYDR382W 333 nt13.85□□□□□ -0.19
XDJ1P39102 YOL037CYOL037C 354 nt13.83□□□□□ -0.2
XDJ1P39102 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.82□□□□□ -0.2
XDJ1P39102 Q0182Q0182 405 nt13.81□□□□□ -0.2
XDJ1P39102 POA1YBR022W 534 nt13.78□□□□□ -0.2
XDJ1P39102 PTC2YER089C 1395 nt13.76□□□□□ -0.21
XDJ1P39102 RKM5YLR137W 1104 nt13.73□□□□□ -0.21
XDJ1P39102 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.71□□□□□ -0.21
XDJ1P39102 SSA3YBL075C 1950 nt13.7□□□□□ -0.22
XDJ1P39102 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.69□□□□□ -0.22
XDJ1P39102 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.69□□□□□ -0.22
XDJ1P39102 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.69□□□□□ -0.22
XDJ1P39102 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.69□□□□□ -0.22
XDJ1P39102 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.69□□□□□ -0.22
XDJ1P39102 BDH2YAL061W 1254 nt13.65□□□□□ -0.22
XDJ1P39102 YDR509WYDR509W 348 nt13.56□□□□□ -0.24
XDJ1P39102 LSM3YLR438C-A 270 nt13.55□□□□□ -0.24
XDJ1P39102 NAB2YGL122C 1578 nt13.54□□□□□ -0.24
XDJ1P39102 BUD23YCR047C 828 nt13.51□□□□□ -0.25
XDJ1P39102 INM2YDR287W 879 nt13.51□□□□□ -0.25
XDJ1P39102 MOT3YMR070W 1473 nt13.5□□□□□ -0.25
XDJ1P39102 BSC6YOL137W 1494 nt13.5□□□□□ -0.25
XDJ1P39102 YLR281CYLR281C 468 nt13.49□□□□□ -0.25
XDJ1P39102 Q0017Q0017 162 nt13.49□□□□□ -0.25
XDJ1P39102 PUS2YGL063W 1113 nt13.45□□□□□ -0.26
XDJ1P39102 DAL1YIR027C 1383 nt13.44□□□□□ -0.26
XDJ1P39102 YBL100CYBL100C 315 nt13.42□□□□□ -0.26
XDJ1P39102 FIS1YIL065C 468 nt13.39□□□□□ -0.27
XDJ1P39102 WHI5YOR083W 888 nt13.38□□□□□ -0.27
XDJ1P39102 FPR4YLR449W 1179 nt13.37□□□□□ -0.27
XDJ1P39102 TRM9YML014W 840 nt13.32□□□□□ -0.28
XDJ1P39102 PHO4YFR034C 939 nt13.3□□□□□ -0.28
XDJ1P39102 Q0142Q0142 177 nt13.28□□□□□ -0.28
XDJ1P39102 FUN26YAL022C 1554 nt13.28□□□□□ -0.28
XDJ1P39102 CCT6YDR188W 1641 nt13.18□□□□□ -0.3
XDJ1P39102 DSK2YMR276W 1122 nt13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms