Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRD1Q06106 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.92■■□□□ 1.42
MRD1Q06106 NSR1YGR159C 1245 nt23.67■■□□□ 1.38
MRD1Q06106 NOP1YDL014W 984 nt23.36■■□□□ 1.33
MRD1Q06106 YKL036CYKL036C 393 nt21.69■■□□□ 1.06
MRD1Q06106 MDJ1YFL016C 1536 nt20.82■□□□□ 0.92
MRD1Q06106 Q0297Q0297 156 nt20.51■□□□□ 0.87
MRD1Q06106 SRX1YKL086W 384 nt20.41■□□□□ 0.86
MRD1Q06106 YJL027CYJL027C 417 nt20.28■□□□□ 0.84
MRD1Q06106 SCS3YGL126W 1143 nt19.82■□□□□ 0.76
MRD1Q06106 YCR051WYCR051W 669 nt19.34■□□□□ 0.69
MRD1Q06106 YOL085CYOL085C 342 nt18.78■□□□□ 0.6
MRD1Q06106 DBP2YNL112W 1641 nt18.52■□□□□ 0.55
MRD1Q06106 PKP1YIL042C 1185 nt18.44■□□□□ 0.54
MRD1Q06106 RPP1BYDL130W 321 nt18.39■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.36■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.36■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.36■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.36■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.36■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.36■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.36■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.36■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.36■□□□□ 0.53
MRD1Q06106 CCC1YLR220W 969 nt18.13■□□□□ 0.49
MRD1Q06106 SCJ1YMR214W 1134 nt17.79■□□□□ 0.44
MRD1Q06106 ATS1YAL020C 1002 nt17.78■□□□□ 0.44
MRD1Q06106 YBR190WYBR190W 312 nt17.75■□□□□ 0.43
MRD1Q06106 PET122YER153C 765 nt17.53■□□□□ 0.4
MRD1Q06106 RVS167YDR388W 1449 nt17.46■□□□□ 0.39
MRD1Q06106 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.41■□□□□ 0.38
MRD1Q06106 SCR1SCR1 522 nt17.41■□□□□ 0.38
MRD1Q06106 RTC3YHR087W 336 nt17.33■□□□□ 0.36
MRD1Q06106 RRN5YLR141W 1092 nt17.04■□□□□ 0.32
MRD1Q06106 SHR5YOL110W 714 nt16.89■□□□□ 0.29
MRD1Q06106 YDJ1YNL064C 1230 nt16.86■□□□□ 0.29
MRD1Q06106 RSB1YOR049C 1065 nt16.74■□□□□ 0.27
MRD1Q06106 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.72■□□□□ 0.27
MRD1Q06106 PST2YDR032C 597 nt16.45■□□□□ 0.22
MRD1Q06106 GAR1YHR089C 618 nt16.43■□□□□ 0.22
MRD1Q06106 DEP1YAL013W 1218 nt16.31■□□□□ 0.2
MRD1Q06106 URN1YPR152C 1398 nt16.29■□□□□ 0.2
MRD1Q06106 YNL208WYNL208W 600 nt16.12■□□□□ 0.17
MRD1Q06106 RPN10YHR200W 807 nt16.11■□□□□ 0.17
MRD1Q06106 OPI9YLR338W 858 nt16.04■□□□□ 0.16
MRD1Q06106 PUT4YOR348C 1884 nt15.97■□□□□ 0.15
MRD1Q06106 TIR1YER011W 765 nt15.88■□□□□ 0.13
MRD1Q06106 YKL097CYKL097C 411 nt15.87■□□□□ 0.13
MRD1Q06106 SAH1YER043C 1350 nt15.87■□□□□ 0.13
MRD1Q06106 ARE1YCR048W 1833 nt15.73■□□□□ 0.11
MRD1Q06106 SHU1YHL006C 453 nt15.72■□□□□ 0.11
MRD1Q06106 SSA1YAL005C 1929 nt15.65■□□□□ 0.1
MRD1Q06106 PUN1YLR414C 792 nt15.58■□□□□ 0.08
MRD1Q06106 YJR018WYJR018W 363 nt15.56■□□□□ 0.08
MRD1Q06106 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.52■□□□□ 0.08
MRD1Q06106 POA1YBR022W 534 nt15.46■□□□□ 0.07
MRD1Q06106 SRB2YHR041C 633 nt15.4■□□□□ 0.06
MRD1Q06106 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.4■□□□□ 0.06
MRD1Q06106 SSA3YBL075C 1950 nt15.38■□□□□ 0.05
MRD1Q06106 YJR120WYJR120W 351 nt15.36■□□□□ 0.05
MRD1Q06106 PTC2YER089C 1395 nt15.35■□□□□ 0.05
MRD1Q06106 RPP2BYDR382W 333 nt15.3■□□□□ 0.04
MRD1Q06106 WWM1YFL010C 636 nt15.2■□□□□ 0.02
MRD1Q06106 YGR021WYGR021W 873 nt15.2■□□□□ 0.02
MRD1Q06106 YOR139CYOR139C 393 nt15.2■□□□□ 0.02
MRD1Q06106 BUD23YCR047C 828 nt15.16■□□□□ 0.02
MRD1Q06106 HOM6YJR139C 1080 nt15.14■□□□□ 0.01
MRD1Q06106 NAB2YGL122C 1578 nt15.13■□□□□ 0.01
MRD1Q06106 BSC6YOL137W 1494 nt15.11■□□□□ 0.01
MRD1Q06106 MNP1YGL068W 585 nt15.06■□□□□ 0
MRD1Q06106 NPL3YDR432W 1245 nt15.04■□□□□ -0
MRD1Q06106 BDH2YAL061W 1254 nt15.03■□□□□ -0
MRD1Q06106 INM2YDR287W 879 nt15□□□□□ -0.01
MRD1Q06106 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.98□□□□□ -0.01
MRD1Q06106 DAL1YIR027C 1383 nt14.97□□□□□ -0.01
MRD1Q06106 FIS1YIL065C 468 nt14.94□□□□□ -0.02
MRD1Q06106 RKM5YLR137W 1104 nt14.91□□□□□ -0.02
MRD1Q06106 YOL037CYOL037C 354 nt14.91□□□□□ -0.02
MRD1Q06106 FPR4YLR449W 1179 nt14.9□□□□□ -0.02
MRD1Q06106 LSM3YLR438C-A 270 nt14.88□□□□□ -0.03
MRD1Q06106 YBL100CYBL100C 315 nt14.87□□□□□ -0.03
MRD1Q06106 PHO4YFR034C 939 nt14.82□□□□□ -0.04
MRD1Q06106 FUN26YAL022C 1554 nt14.7□□□□□ -0.06
MRD1Q06106 TRM9YML014W 840 nt14.7□□□□□ -0.06
MRD1Q06106 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.61□□□□□ -0.07
MRD1Q06106 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.61□□□□□ -0.07
MRD1Q06106 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.61□□□□□ -0.07
MRD1Q06106 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.61□□□□□ -0.07
MRD1Q06106 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.61□□□□□ -0.07
MRD1Q06106 CCT6YDR188W 1641 nt14.57□□□□□ -0.08
MRD1Q06106 YLR281CYLR281C 468 nt14.54□□□□□ -0.08
MRD1Q06106 YPS1YLR120C 1710 nt14.48□□□□□ -0.09
MRD1Q06106 WHI5YOR083W 888 nt14.46□□□□□ -0.09
MRD1Q06106 PUS2YGL063W 1113 nt14.44□□□□□ -0.1
MRD1Q06106 ALF1YNL148C 765 nt14.44□□□□□ -0.1
MRD1Q06106 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.43□□□□□ -0.1
MRD1Q06106 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.43□□□□□ -0.1
MRD1Q06106 YDR095CYDR095C 411 nt14.42□□□□□ -0.1
MRD1Q06106 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.32□□□□□ -0.12
MRD1Q06106 SPT5YML010W 3192 nt14.29□□□□□ -0.12
MRD1Q06106 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.28□□□□□ -0.12
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