Protein–RNA interactions for Protein: P38349

UBX7, UBX domain-containing protein 7, yeastyeast

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX7P38349 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.2■■□□□ 1.14
UBX7P38349 NSR1YGR159C 1245 nt21.75■■□□□ 1.07
UBX7P38349 NOP1YDL014W 984 nt21.67■■□□□ 1.06
UBX7P38349 YKL036CYKL036C 393 nt20.32■□□□□ 0.84
UBX7P38349 Q0297Q0297 156 nt19.08■□□□□ 0.64
UBX7P38349 MDJ1YFL016C 1536 nt19.06■□□□□ 0.64
UBX7P38349 YJL027CYJL027C 417 nt19.04■□□□□ 0.64
UBX7P38349 SRX1YKL086W 384 nt18.95■□□□□ 0.62
UBX7P38349 SCS3YGL126W 1143 nt18.67■□□□□ 0.58
UBX7P38349 YCR051WYCR051W 669 nt18.04■□□□□ 0.48
UBX7P38349 YOL085CYOL085C 342 nt17.62■□□□□ 0.41
UBX7P38349 PKP1YIL042C 1185 nt17.35■□□□□ 0.37
UBX7P38349 RPP1BYDL130W 321 nt17.14■□□□□ 0.33
UBX7P38349 DBP2YNL112W 1641 nt16.99■□□□□ 0.31
UBX7P38349 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.94■□□□□ 0.3
UBX7P38349 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.94■□□□□ 0.3
UBX7P38349 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.94■□□□□ 0.3
UBX7P38349 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.94■□□□□ 0.3
UBX7P38349 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.94■□□□□ 0.3
UBX7P38349 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.94■□□□□ 0.3
UBX7P38349 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.94■□□□□ 0.3
UBX7P38349 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.94■□□□□ 0.3
UBX7P38349 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.94■□□□□ 0.3
UBX7P38349 SCJ1YMR214W 1134 nt16.88■□□□□ 0.29
UBX7P38349 CCC1YLR220W 969 nt16.84■□□□□ 0.29
UBX7P38349 ATS1YAL020C 1002 nt16.79■□□□□ 0.28
UBX7P38349 PET122YER153C 765 nt16.36■□□□□ 0.21
UBX7P38349 SCR1SCR1 522 nt16.23■□□□□ 0.19
UBX7P38349 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.16■□□□□ 0.18
UBX7P38349 YBR190WYBR190W 312 nt16.12■□□□□ 0.17
UBX7P38349 RVS167YDR388W 1449 nt15.99■□□□□ 0.15
UBX7P38349 RRN5YLR141W 1092 nt15.94■□□□□ 0.14
UBX7P38349 RTC3YHR087W 336 nt15.82■□□□□ 0.12
UBX7P38349 RSB1YOR049C 1065 nt15.69■□□□□ 0.1
UBX7P38349 Q0182Q0182 405 nt15.68■□□□□ 0.1
UBX7P38349 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.62■□□□□ 0.09
UBX7P38349 YDJ1YNL064C 1230 nt15.6■□□□□ 0.09
UBX7P38349 SHR5YOL110W 714 nt15.53■□□□□ 0.08
UBX7P38349 PST2YDR032C 597 nt15.51■□□□□ 0.07
UBX7P38349 MOT3YMR070W 1473 nt15.41■□□□□ 0.06
UBX7P38349 GAR1YHR089C 618 nt15.25■□□□□ 0.03
UBX7P38349 DEP1YAL013W 1218 nt15.05■□□□□ -0
UBX7P38349 YKL097CYKL097C 411 nt15.04■□□□□ -0
UBX7P38349 URN1YPR152C 1398 nt14.92□□□□□ -0.02
UBX7P38349 SHU1YHL006C 453 nt14.81□□□□□ -0.04
UBX7P38349 YNL208WYNL208W 600 nt14.79□□□□□ -0.04
UBX7P38349 RPN10YHR200W 807 nt14.71□□□□□ -0.05
UBX7P38349 TIR1YER011W 765 nt14.7□□□□□ -0.06
UBX7P38349 OPI9YLR338W 858 nt14.62□□□□□ -0.07
UBX7P38349 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.53□□□□□ -0.08
UBX7P38349 SSA1YAL005C 1929 nt14.49□□□□□ -0.09
UBX7P38349 SAH1YER043C 1350 nt14.48□□□□□ -0.09
UBX7P38349 YOR139CYOR139C 393 nt14.42□□□□□ -0.1
UBX7P38349 PUT4YOR348C 1884 nt14.4□□□□□ -0.1
UBX7P38349 SRB2YHR041C 633 nt14.36□□□□□ -0.11
UBX7P38349 ARE1YCR048W 1833 nt14.25□□□□□ -0.13
UBX7P38349 YJR018WYJR018W 363 nt14.24□□□□□ -0.13
UBX7P38349 NPL3YDR432W 1245 nt14.18□□□□□ -0.14
UBX7P38349 PUN1YLR414C 792 nt14.18□□□□□ -0.14
UBX7P38349 WWM1YFL010C 636 nt14.14□□□□□ -0.15
UBX7P38349 YJR120WYJR120W 351 nt14.13□□□□□ -0.15
UBX7P38349 MNP1YGL068W 585 nt14.1□□□□□ -0.15
UBX7P38349 HOM6YJR139C 1080 nt14.09□□□□□ -0.15
UBX7P38349 YGR021WYGR021W 873 nt14.08□□□□□ -0.16
UBX7P38349 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.07□□□□□ -0.16
UBX7P38349 RPP2BYDR382W 333 nt14.02□□□□□ -0.17
UBX7P38349 POA1YBR022W 534 nt14.02□□□□□ -0.17
UBX7P38349 PTC2YER089C 1395 nt13.99□□□□□ -0.17
UBX7P38349 YOL037CYOL037C 354 nt13.93□□□□□ -0.18
UBX7P38349 RKM5YLR137W 1104 nt13.89□□□□□ -0.19
UBX7P38349 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.85□□□□□ -0.19
UBX7P38349 SSA3YBL075C 1950 nt13.83□□□□□ -0.19
UBX7P38349 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.83□□□□□ -0.2
UBX7P38349 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.83□□□□□ -0.2
UBX7P38349 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.83□□□□□ -0.2
UBX7P38349 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.83□□□□□ -0.2
UBX7P38349 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.83□□□□□ -0.2
UBX7P38349 BDH2YAL061W 1254 nt13.8□□□□□ -0.2
UBX7P38349 BUD23YCR047C 828 nt13.79□□□□□ -0.2
UBX7P38349 NAB2YGL122C 1578 nt13.73□□□□□ -0.21
UBX7P38349 INM2YDR287W 879 nt13.68□□□□□ -0.22
UBX7P38349 LSM3YLR438C-A 270 nt13.68□□□□□ -0.22
UBX7P38349 FPR4YLR449W 1179 nt13.64□□□□□ -0.23
UBX7P38349 YLR281CYLR281C 468 nt13.63□□□□□ -0.23
UBX7P38349 BSC6YOL137W 1494 nt13.62□□□□□ -0.23
UBX7P38349 DAL1YIR027C 1383 nt13.62□□□□□ -0.23
UBX7P38349 PUS2YGL063W 1113 nt13.62□□□□□ -0.23
UBX7P38349 YBL100CYBL100C 315 nt13.62□□□□□ -0.23
UBX7P38349 FIS1YIL065C 468 nt13.59□□□□□ -0.23
UBX7P38349 WHI5YOR083W 888 nt13.55□□□□□ -0.24
UBX7P38349 PHO4YFR034C 939 nt13.5□□□□□ -0.25
UBX7P38349 TRM9YML014W 840 nt13.5□□□□□ -0.25
UBX7P38349 FUN26YAL022C 1554 nt13.47□□□□□ -0.25
UBX7P38349 YPR011CYPR011C 981 nt13.35□□□□□ -0.27
UBX7P38349 NME1NME1 340 nt13.34□□□□□ -0.27
UBX7P38349 CCT6YDR188W 1641 nt13.32□□□□□ -0.28
UBX7P38349 FMP45YDL222C 930 nt13.28□□□□□ -0.28
UBX7P38349 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.28□□□□□ -0.28
UBX7P38349 DSK2YMR276W 1122 nt13.27□□□□□ -0.29
UBX7P38349 YLR236CYLR236C 324 nt13.26□□□□□ -0.29
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