Protein–RNA interactions for Protein: P39928

SLN1, Osmosensing histidine protein kinase SLN1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLN1P39928 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.97■■□□□ 1.43
SLN1P39928 NSR1YGR159C 1245 nt23.75■■□□□ 1.39
SLN1P39928 NOP1YDL014W 984 nt23.39■■□□□ 1.33
SLN1P39928 YKL036CYKL036C 393 nt21.71■■□□□ 1.07
SLN1P39928 MDJ1YFL016C 1536 nt21.04■□□□□ 0.96
SLN1P39928 Q0297Q0297 156 nt20.53■□□□□ 0.88
SLN1P39928 SRX1YKL086W 384 nt20.45■□□□□ 0.86
SLN1P39928 YJL027CYJL027C 417 nt20.28■□□□□ 0.84
SLN1P39928 SCS3YGL126W 1143 nt19.81■□□□□ 0.76
SLN1P39928 YCR051WYCR051W 669 nt19.38■□□□□ 0.69
SLN1P39928 YOL085CYOL085C 342 nt18.8■□□□□ 0.6
SLN1P39928 DBP2YNL112W 1641 nt18.57■□□□□ 0.56
SLN1P39928 PKP1YIL042C 1185 nt18.46■□□□□ 0.55
SLN1P39928 RPP1BYDL130W 321 nt18.42■□□□□ 0.54
SLN1P39928 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.39■□□□□ 0.53
SLN1P39928 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.39■□□□□ 0.53
SLN1P39928 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.39■□□□□ 0.53
SLN1P39928 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.39■□□□□ 0.53
SLN1P39928 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.39■□□□□ 0.53
SLN1P39928 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.39■□□□□ 0.53
SLN1P39928 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.39■□□□□ 0.53
SLN1P39928 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.39■□□□□ 0.53
SLN1P39928 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.39■□□□□ 0.53
SLN1P39928 CCC1YLR220W 969 nt18.18■□□□□ 0.5
SLN1P39928 YBR190WYBR190W 312 nt17.99■□□□□ 0.47
SLN1P39928 ATS1YAL020C 1002 nt17.77■□□□□ 0.44
SLN1P39928 SCJ1YMR214W 1134 nt17.77■□□□□ 0.44
SLN1P39928 SSA3YBL075C 1950 nt17.68■□□□□ 0.42
SLN1P39928 PET122YER153C 765 nt17.56■□□□□ 0.4
SLN1P39928 RTC3YHR087W 336 nt17.56■□□□□ 0.4
SLN1P39928 RVS167YDR388W 1449 nt17.5■□□□□ 0.39
SLN1P39928 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.45■□□□□ 0.38
SLN1P39928 SCR1SCR1 522 nt17.43■□□□□ 0.38
SLN1P39928 RRN5YLR141W 1092 nt17.08■□□□□ 0.32
SLN1P39928 PUT4YOR348C 1884 nt17■□□□□ 0.31
SLN1P39928 SHR5YOL110W 714 nt16.93■□□□□ 0.3
SLN1P39928 YDJ1YNL064C 1230 nt16.9■□□□□ 0.3
SLN1P39928 RSB1YOR049C 1065 nt16.76■□□□□ 0.27
SLN1P39928 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.74■□□□□ 0.27
SLN1P39928 ARE1YCR048W 1833 nt16.48■□□□□ 0.23
SLN1P39928 GAR1YHR089C 618 nt16.47■□□□□ 0.23
SLN1P39928 PST2YDR032C 597 nt16.44■□□□□ 0.22
SLN1P39928 POA1YBR022W 534 nt16.4■□□□□ 0.22
SLN1P39928 DEP1YAL013W 1218 nt16.37■□□□□ 0.21
SLN1P39928 URN1YPR152C 1398 nt16.36■□□□□ 0.21
SLN1P39928 SAH1YER043C 1350 nt16.26■□□□□ 0.19
SLN1P39928 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.25■□□□□ 0.19
SLN1P39928 BSC6YOL137W 1494 nt16.19■□□□□ 0.18
SLN1P39928 RPN10YHR200W 807 nt16.17■□□□□ 0.18
SLN1P39928 YNL208WYNL208W 600 nt16.16■□□□□ 0.18
SLN1P39928 OPI9YLR338W 858 nt16.11■□□□□ 0.17
SLN1P39928 SPT5YML010W 3192 nt16.05■□□□□ 0.16
SLN1P39928 TIR1YER011W 765 nt15.92■□□□□ 0.14
SLN1P39928 YKL097CYKL097C 411 nt15.85■□□□□ 0.13
SLN1P39928 BUD23YCR047C 828 nt15.79■□□□□ 0.12
SLN1P39928 SSA4YER103W 1929 nt15.78■□□□□ 0.12
SLN1P39928 SHU1YHL006C 453 nt15.72■□□□□ 0.11
SLN1P39928 SSA1YAL005C 1929 nt15.69■□□□□ 0.1
SLN1P39928 PUN1YLR414C 792 nt15.65■□□□□ 0.1
SLN1P39928 YJR018WYJR018W 363 nt15.62■□□□□ 0.09
SLN1P39928 PTC2YER089C 1395 nt15.59■□□□□ 0.09
SLN1P39928 SRB2YHR041C 633 nt15.43■□□□□ 0.06
SLN1P39928 NAB2YGL122C 1578 nt15.43■□□□□ 0.06
SLN1P39928 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.42■□□□□ 0.06
SLN1P39928 YJR120WYJR120W 351 nt15.4■□□□□ 0.06
SLN1P39928 RPP2BYDR382W 333 nt15.35■□□□□ 0.05
SLN1P39928 BDF1YLR399C 2061 nt15.28■□□□□ 0.04
SLN1P39928 FIS1YIL065C 468 nt15.26■□□□□ 0.03
SLN1P39928 MEP2YNL142W 1500 nt15.25■□□□□ 0.03
SLN1P39928 WWM1YFL010C 636 nt15.23■□□□□ 0.03
SLN1P39928 YGR021WYGR021W 873 nt15.21■□□□□ 0.03
SLN1P39928 YOR139CYOR139C 393 nt15.19■□□□□ 0.02
SLN1P39928 HOM6YJR139C 1080 nt15.16■□□□□ 0.02
SLN1P39928 DAL1YIR027C 1383 nt15.11■□□□□ 0.01
SLN1P39928 BDH2YAL061W 1254 nt15.08■□□□□ 0
SLN1P39928 FPR4YLR449W 1179 nt15.08■□□□□ 0
SLN1P39928 DCW1YKL046C 1350 nt15.08■□□□□ 0
SLN1P39928 INM2YDR287W 879 nt15.07■□□□□ 0
SLN1P39928 MNP1YGL068W 585 nt15.07■□□□□ 0
SLN1P39928 NPL3YDR432W 1245 nt15.04■□□□□ -0
SLN1P39928 TAT1YBR069C 1860 nt15.03■□□□□ -0
SLN1P39928 PHO4YFR034C 939 nt15.02■□□□□ -0
SLN1P39928 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.01□□□□□ -0.01
SLN1P39928 YPS1YLR120C 1710 nt14.97□□□□□ -0.01
SLN1P39928 RKM5YLR137W 1104 nt14.93□□□□□ -0.02
SLN1P39928 LSM3YLR438C-A 270 nt14.92□□□□□ -0.02
SLN1P39928 YBL100CYBL100C 315 nt14.92□□□□□ -0.02
SLN1P39928 YOL037CYOL037C 354 nt14.91□□□□□ -0.02
SLN1P39928 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.82□□□□□ -0.04
SLN1P39928 EMI2YDR516C 1503 nt14.79□□□□□ -0.04
SLN1P39928 YBR220CYBR220C 1683 nt14.78□□□□□ -0.04
SLN1P39928 YDR095CYDR095C 411 nt14.77□□□□□ -0.05
SLN1P39928 TRM9YML014W 840 nt14.77□□□□□ -0.05
SLN1P39928 FUN26YAL022C 1554 nt14.76□□□□□ -0.05
SLN1P39928 CAC2YML102W 1407 nt14.63□□□□□ -0.07
SLN1P39928 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.61□□□□□ -0.07
SLN1P39928 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.61□□□□□ -0.07
SLN1P39928 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.61□□□□□ -0.07
SLN1P39928 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.61□□□□□ -0.07
SLN1P39928 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.61□□□□□ -0.07
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