Protein–RNA interactions for Protein: Q04013

YHM2, Citrate/oxoglutarate carrier protein, yeastyeast

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHM2Q04013 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.03■□□□□ 0.96
YHM2Q04013 NOP1YDL014W 984 nt20.63■□□□□ 0.89
YHM2Q04013 NSR1YGR159C 1245 nt20.52■□□□□ 0.88
YHM2Q04013 YKL036CYKL036C 393 nt19.47■□□□□ 0.71
YHM2Q04013 YJL027CYJL027C 417 nt18.24■□□□□ 0.51
YHM2Q04013 Q0297Q0297 156 nt18.23■□□□□ 0.51
YHM2Q04013 SRX1YKL086W 384 nt18.05■□□□□ 0.48
YHM2Q04013 SCS3YGL126W 1143 nt17.97■□□□□ 0.47
YHM2Q04013 MDJ1YFL016C 1536 nt17.78■□□□□ 0.44
YHM2Q04013 YCR051WYCR051W 669 nt17.12■□□□□ 0.33
YHM2Q04013 YOL085CYOL085C 342 nt16.85■□□□□ 0.29
YHM2Q04013 PKP1YIL042C 1185 nt16.52■□□□□ 0.24
YHM2Q04013 SCJ1YMR214W 1134 nt16.5■□□□□ 0.23
YHM2Q04013 RPP1BYDL130W 321 nt16.35■□□□□ 0.21
YHM2Q04013 ATS1YAL020C 1002 nt16.18■□□□□ 0.18
YHM2Q04013 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.07■□□□□ 0.16
YHM2Q04013 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.07■□□□□ 0.16
YHM2Q04013 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.07■□□□□ 0.16
YHM2Q04013 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.07■□□□□ 0.16
YHM2Q04013 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.07■□□□□ 0.16
YHM2Q04013 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.07■□□□□ 0.16
YHM2Q04013 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.07■□□□□ 0.16
YHM2Q04013 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.07■□□□□ 0.16
YHM2Q04013 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.07■□□□□ 0.16
YHM2Q04013 DBP2YNL112W 1641 nt15.94■□□□□ 0.14
YHM2Q04013 CCC1YLR220W 969 nt15.85■□□□□ 0.13
YHM2Q04013 PET122YER153C 765 nt15.57■□□□□ 0.08
YHM2Q04013 SCR1SCR1 522 nt15.51■□□□□ 0.07
YHM2Q04013 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.33■□□□□ 0.04
YHM2Q04013 RRN5YLR141W 1092 nt15.15■□□□□ 0.02
YHM2Q04013 RVS167YDR388W 1449 nt15.07■□□□□ 0
YHM2Q04013 YBR190WYBR190W 312 nt15.05■□□□□ -0
YHM2Q04013 RTC3YHR087W 336 nt14.97□□□□□ -0.01
YHM2Q04013 RSB1YOR049C 1065 nt14.97□□□□□ -0.01
YHM2Q04013 PST2YDR032C 597 nt14.92□□□□□ -0.02
YHM2Q04013 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.87□□□□□ -0.03
YHM2Q04013 YDJ1YNL064C 1230 nt14.84□□□□□ -0.03
YHM2Q04013 SHR5YOL110W 714 nt14.67□□□□□ -0.06
YHM2Q04013 YKL097CYKL097C 411 nt14.56□□□□□ -0.08
YHM2Q04013 GAR1YHR089C 618 nt14.4□□□□□ -0.1
YHM2Q04013 SHU1YHL006C 453 nt14.21□□□□□ -0.13
YHM2Q04013 DEP1YAL013W 1218 nt14.06□□□□□ -0.16
YHM2Q04013 URN1YPR152C 1398 nt13.96□□□□□ -0.17
YHM2Q04013 TIR1YER011W 765 nt13.91□□□□□ -0.18
YHM2Q04013 YNL208WYNL208W 600 nt13.91□□□□□ -0.18
YHM2Q04013 YOR139CYOR139C 393 nt13.91□□□□□ -0.18
YHM2Q04013 RPN10YHR200W 807 nt13.86□□□□□ -0.19
YHM2Q04013 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.82□□□□□ -0.2
YHM2Q04013 OPI9YLR338W 858 nt13.68□□□□□ -0.22
YHM2Q04013 NPL3YDR432W 1245 nt13.67□□□□□ -0.22
YHM2Q04013 SSA1YAL005C 1929 nt13.66□□□□□ -0.22
YHM2Q04013 SRB2YHR041C 633 nt13.53□□□□□ -0.24
YHM2Q04013 SAH1YER043C 1350 nt13.46□□□□□ -0.25
YHM2Q04013 YGR021WYGR021W 873 nt13.45□□□□□ -0.26
YHM2Q04013 HOM6YJR139C 1080 nt13.44□□□□□ -0.26
YHM2Q04013 MNP1YGL068W 585 nt13.43□□□□□ -0.26
YHM2Q04013 Q0182Q0182 405 nt13.41□□□□□ -0.26
YHM2Q04013 YOL037CYOL037C 354 nt13.4□□□□□ -0.26
YHM2Q04013 WWM1YFL010C 636 nt13.38□□□□□ -0.27
YHM2Q04013 YJR018WYJR018W 363 nt13.35□□□□□ -0.27
YHM2Q04013 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YHM2Q04013 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YHM2Q04013 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YHM2Q04013 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YHM2Q04013 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.33□□□□□ -0.28
YHM2Q04013 PUT4YOR348C 1884 nt13.33□□□□□ -0.28
YHM2Q04013 YJR120WYJR120W 351 nt13.28□□□□□ -0.28
YHM2Q04013 PUN1YLR414C 792 nt13.28□□□□□ -0.28
YHM2Q04013 RKM5YLR137W 1104 nt13.24□□□□□ -0.29
YHM2Q04013 ARE1YCR048W 1833 nt13.23□□□□□ -0.29
YHM2Q04013 RPP2BYDR382W 333 nt13.19□□□□□ -0.3
YHM2Q04013 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.17□□□□□ -0.3
YHM2Q04013 SSA3YBL075C 1950 nt13.12□□□□□ -0.31
YHM2Q04013 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.05□□□□□ -0.32
YHM2Q04013 YLR281CYLR281C 468 nt13.05□□□□□ -0.32
YHM2Q04013 PUS2YGL063W 1113 nt13.04□□□□□ -0.32
YHM2Q04013 BDH2YAL061W 1254 nt13.03□□□□□ -0.32
YHM2Q04013 PTC2YER089C 1395 nt13.02□□□□□ -0.33
YHM2Q04013 MOT3YMR070W 1473 nt12.99□□□□□ -0.33
YHM2Q04013 LSM3YLR438C-A 270 nt12.95□□□□□ -0.34
YHM2Q04013 WHI5YOR083W 888 nt12.92□□□□□ -0.34
YHM2Q04013 POA1YBR022W 534 nt12.92□□□□□ -0.34
YHM2Q04013 INM2YDR287W 879 nt12.81□□□□□ -0.36
YHM2Q04013 NAB2YGL122C 1578 nt12.8□□□□□ -0.36
YHM2Q04013 BSC6YOL137W 1494 nt12.79□□□□□ -0.36
YHM2Q04013 YBL100CYBL100C 315 nt12.77□□□□□ -0.37
YHM2Q04013 BUD23YCR047C 828 nt12.75□□□□□ -0.37
YHM2Q04013 DAL1YIR027C 1383 nt12.73□□□□□ -0.37
YHM2Q04013 FMP45YDL222C 930 nt12.72□□□□□ -0.37
YHM2Q04013 DSK2YMR276W 1122 nt12.71□□□□□ -0.37
YHM2Q04013 YPR011CYPR011C 981 nt12.71□□□□□ -0.37
YHM2Q04013 FIS1YIL065C 468 nt12.7□□□□□ -0.38
YHM2Q04013 MRPL8YJL063C 717 nt12.67□□□□□ -0.38
YHM2Q04013 YLR236CYLR236C 324 nt12.67□□□□□ -0.38
YHM2Q04013 TRM9YML014W 840 nt12.67□□□□□ -0.38
YHM2Q04013 FPR4YLR449W 1179 nt12.66□□□□□ -0.38
YHM2Q04013 IMP2'YIL154C 1041 nt12.65□□□□□ -0.38
YHM2Q04013 FUN26YAL022C 1554 nt12.64□□□□□ -0.39
YHM2Q04013 YCH1YGR203W 447 nt12.63□□□□□ -0.39
YHM2Q04013 PHO4YFR034C 939 nt12.61□□□□□ -0.39
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