Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A5

SBDS, Ribosome maturation protein SBDS, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBDSQ9Y3A5 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-282■■■■■ 546.7
SBDSQ9Y3A5 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)22.72■■□□□ 1.235e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.815e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.02■□□□□ 0.85e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 219.14■□□□□ 0.655e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.395e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.15e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.675e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.28□□□□□ -0.925e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.28□□□□□ -0.925e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.59□□□□□ -1.035e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 42.4□□□□□ -2.035e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 50.58□□□□□ -2.325e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 50.26□□□□□ -2.375e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.45e-47■■■■■ 274.1
SBDSQ9Y3A5 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.07□□□□□ -1.442e-39■■■■■ 119.2
SBDSQ9Y3A5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-15■■■■■ 95.8
SBDSQ9Y3A5 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.291e-15■■■■■ 95.8
SBDSQ9Y3A5 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-15■■■■■ 95.8
SBDSQ9Y3A5 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.651e-15■■■■■ 95.8
SBDSQ9Y3A5 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC8.91□□□□□ -0.981e-15■■■■■ 95.8
SBDSQ9Y3A5 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.922e-15■■■■■ 91.4
SBDSQ9Y3A5 HMCN1-204ENST00000485744 1884 ntTSL 210.65□□□□□ -0.71e-10■■■■■ 63.5
SBDSQ9Y3A5 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.521e-10■■■■■ 63.5
SBDSQ9Y3A5 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 59.03□□□□□ -0.961e-8■■■■■ 51.6
SBDSQ9Y3A5 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 52.54□□□□□ -21e-8■■■■■ 51.6
SBDSQ9Y3A5 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 51.96□□□□□ -2.11e-8■■■■■ 51.6
SBDSQ9Y3A5 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.211e-8■■■■■ 51.6
SBDSQ9Y3A5 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 50.87□□□□□ -2.271e-8■■■■■ 51.6
SBDSQ9Y3A5 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 49
SBDSQ9Y3A5 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.031e-323■■■■■ 46.1
SBDSQ9Y3A5 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-323■■■■■ 46.1
SBDSQ9Y3A5 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 212.69□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 46.1
SBDSQ9Y3A5 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.21□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 43.7
SBDSQ9Y3A5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 215.14■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 CACNA2D4-206ENST00000537784 2876 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 CACNA2D4-202ENST00000382722 5475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 CACNA2D4-203ENST00000444595 4450 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 CACNA2D4-222ENST00000587995 3883 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 CACNA2D4-221ENST00000586184 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 CACNA2D4-223ENST00000588077 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 39.7
SBDSQ9Y3A5 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.018e-12■■■■■ 37.7
SBDSQ9Y3A5 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.138e-12■■■■■ 37.7
SBDSQ9Y3A5 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.248e-12■■■■■ 37.7
SBDSQ9Y3A5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.075e-12■■■■■ 35.9
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-209ENST00000588087 2384 ntTSL 222.92■■□□□ 1.264e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.164e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.714e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-210ENST00000588792 843 ntTSL 218.53■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-203ENST00000460750 4738 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-211ENST00000589271 1099 ntTSL 517.87■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 217.01■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-205ENST00000586126 821 ntTSL 316.53■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-223ENST00000592594 551 ntTSL 416.39■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-215ENST00000631193 991 ntTSL 516.13■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-207ENST00000586697 571 ntTSL 415.02■□□□□ -04e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 TMC6-221ENST00000592063 743 ntTSL 513.9□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 KCNT1-210ENST00000490363 4065 ntTSL 513.84□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.4□□□□□ -1.544e-6■■■■■ 35.7
SBDSQ9Y3A5 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)20.68■□□□□ 0.97e-10■■■■■ 31.8
SBDSQ9Y3A5 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.467e-10■■■■■ 31.8
SBDSQ9Y3A5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.783e-16■■■■■ 31.7
SBDSQ9Y3A5 SH3BP1-202ENST00000417536 2858 ntTSL 219.86■□□□□ 0.773e-16■■■■■ 31.7
SBDSQ9Y3A5 SH3BP1-206ENST00000469947 2612 ntTSL 214.34□□□□□ -0.113e-16■■■■■ 31.7
SBDSQ9Y3A5 SH3BP1-203ENST00000451997 3123 ntTSL 213.36□□□□□ -0.273e-16■■■■■ 31.7
SBDSQ9Y3A5 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 316.28■□□□□ 0.21e-323■■■■■ 29.2
SBDSQ9Y3A5 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-323■■■■■ 29.2
SBDSQ9Y3A5 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.751e-323■■■■■ 29.2
SBDSQ9Y3A5 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.861e-323■■■■■ 29.2
SBDSQ9Y3A5 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.191e-323■■■■■ 29.2
SBDSQ9Y3A5 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.861e-323■■■■■ 29.2
SBDSQ9Y3A5 HOXC10-205ENST00000515593 526 ntTSL 48.6□□□□□ -1.036e-8■■■■□ 25.8
SBDSQ9Y3A5 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.835e-10■■■■□ 25.2
SBDSQ9Y3A5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.825e-10■■■■□ 22
SBDSQ9Y3A5 SLC26A5-215ENST00000487407 2098 ntTSL 225.68■■□□□ 1.71e-6■■■■□ 21.8
SBDSQ9Y3A5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.151e-6■■■■□ 21.8
SBDSQ9Y3A5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 21.8
SBDSQ9Y3A5 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 21.8
SBDSQ9Y3A5 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 21.8
SBDSQ9Y3A5 SLC26A5-204ENST00000356767 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 21.8
SBDSQ9Y3A5 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 21.8
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