RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP1-206ENST00000469947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-206ENST00000469947 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-206ENST00000469947 HRCP23327 699 aa22.77■■□□□ 1.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP1-206ENST00000469947 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1-206ENST00000469947 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP1-206ENST00000469947 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP1-206ENST00000469947 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SH3BP1-206ENST00000469947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1-206ENST00000469947 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.05■■□□□ 1.12
SH3BP1-206ENST00000469947 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCC9O60706 1549 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP1-206ENST00000469947 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-206ENST00000469947 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP1-206ENST00000469947 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SH3BP1-206ENST00000469947 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM41Q8WV44 630 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1-206ENST00000469947 SCRIBQ14160 1630 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1-206ENST00000469947 NACADO15069 1562 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1-206ENST00000469947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
SH3BP1-206ENST00000469947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
SH3BP1-206ENST00000469947 NEUROD1Q13562 356 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP1-206ENST00000469947 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP1-206ENST00000469947 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP1-206ENST00000469947 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1-206ENST00000469947 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1-206ENST00000469947 MYT1Q01538 1121 aa20.77■□□□□ 0.92
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SH3BP1-206ENST00000469947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP1-206ENST00000469947 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP1-206ENST00000469947 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP1-206ENST00000469947 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-206ENST00000469947 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP1-206ENST00000469947 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP1-206ENST00000469947 WIZO95785 1651 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-206ENST00000469947 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-206ENST00000469947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.851e-323■■■■■ 56.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CEP162Q5TB80 1403 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCC8Q09428 1581 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 MIER1Q8N108 512 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 SMARCA4P51532 1647 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP1-206ENST00000469947 SOGA1O94964 1423 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1-206ENST00000469947 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1-206ENST00000469947 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-206ENST00000469947 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1-206ENST00000469947 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-206ENST00000469947 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP1-206ENST00000469947 SMARCA2P51531 1590 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 GOLGA3Q08378 1498 aa19.95■□□□□ 0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1-206ENST00000469947 EEA1Q15075 1411 aa19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP1-206ENST00000469947 CLIP1P30622 1438 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1-206ENST00000469947 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 APLP2Q06481 763 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 SYNJ1O43426 1573 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 NCAPD3P42695 1498 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 KIF21BO75037 1637 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNH8Q96L42 1107 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 BCANQ96GW7 911 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-206ENST00000469947 HMGXB3Q12766 1538 aa19.6■□□□□ 0.73
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SH3BP1-206ENST00000469947 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP1-206ENST00000469947 ITGAEP38570 1179 aa19.53■□□□□ 0.72
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SH3BP1-206ENST00000469947 ARAP1Q96P48 1450 aa19.41■□□□□ 0.7
SH3BP1-206ENST00000469947 BCL11AQ9H165 835 aa19.39■□□□□ 0.7
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SH3BP1-206ENST00000469947 CUX2O14529 1486 aa19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1-206ENST00000469947 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1-206ENST00000469947 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 CFTRP13569 1480 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIM52Q96A61 297 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1-206ENST00000469947 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-206ENST00000469947 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP1-206ENST00000469947 PRXQ9BXM0 1461 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP1-206ENST00000469947 MAPKBP1O60336 1514 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP1-206ENST00000469947 TOP2BQ02880 1626 aa19.24■□□□□ 0.67
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