Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.118e-12■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.038e-12■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.048e-12■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.128e-12■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 RCOR3-210ENST00000528408 570 ntTSL 215.95■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 RCOR3-216ENST00000534478 564 ntTSL 415.44■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 RCOR3-214ENST00000533469 540 ntTSL 48.98□□□□□ -0.972e-8■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 MDM2-219ENST00000493419 577 ntTSL 213.45□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ATG16L1-213ENST00000473865 805 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 MDM2-204ENST00000311420 1583 ntTSL 510.26□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)10.13□□□□□ -0.792e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.862e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.92e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 29.12□□□□□ -0.952e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 MDM2-213ENST00000393417 1683 ntTSL 57.06□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 MNT-203ENST00000571836 529 ntTSL 417.15■□□□□ 0.342e-22■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ENAH-202ENST00000358675 3655 ntTSL 24.58□□□□□ -1.684e-16■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 SNX27-202ENST00000368841 7070 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.225e-11■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.55e-11■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 SHPRH-204ENST00000417762 468 ntTSL 27.51□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 SCAMP5-205ENST00000562765 1206 ntTSL 217.96■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 515.53■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 TRIM11-206ENST00000602582 682 ntTSL 314.83□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 TRIM11-205ENST00000602308 586 ntTSL 313.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 213.61□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 NBAS-208ENST00000442506 4391 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.383e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.853e-7■■■■■ 28.6
PCBP2Q15366 ZHX3-208ENST00000441102 688 ntTSL 219.56■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-203ENST00000419740 573 ntTSL 410.81□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-206ENST00000436099 712 ntTSL 210.03□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-207ENST00000436440 792 ntTSL 38.5□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-221ENST00000561291 528 ntTSL 47.66□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 TRIM66-203ENST00000481014 6505 ntTSL 27.25□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.313e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-202ENST00000373261 657 ntTSL 26.77□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.353e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZHX3-210ENST00000487057 522 ntTSL 56.12□□□□□ -1.433e-7■■■■■ 28.5
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PCBP2Q15366 FOCAD-212ENST00000604103 591 ntTSL 44.84□□□□□ -1.633e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 HM13-205ENST00000460225 443 ntTSL 512.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 HM13-203ENST00000344042 847 ntTSL 512.79□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZYX-202ENST00000354434 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.77□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 DYRK1A-208ENST00000498351 224 ntTSL 1 (best)1.95□□□□□ -2.13e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 STAG2-212ENST00000458176 845 ntTSL 314.43□□□□□ -0.15e-10■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.445e-10■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.645e-10■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 SLC44A5-203ENST00000469525 721 ntTSL 56.09□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.722e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 AFF1-206ENST00000507468 1486 ntTSL 1 (best)20.24■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 AFF1-204ENST00000503477 1478 ntTSL 216.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 SNRPA-202ENST00000596860 336 ntTSL 28.55□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 NHSL1-201ENST00000342260 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.71□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 NHSL1-208ENST00000533765 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 46.7□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 NHSL1-203ENST00000426841 947 ntTSL 26.29□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 28.5
PCBP2Q15366 RASSF4-211ENST00000489171 4350 ntTSL 1 (best)18.6■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 RASSF4-202ENST00000427758 528 ntTSL 314.75□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 RASSF4-208ENST00000472561 892 ntTSL 314.21□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 RASSF4-209ENST00000483709 734 ntTSL 514.04□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 RASSF4-203ENST00000428466 435 ntTSL 312.76□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 RASSF4-201ENST00000340258 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 RASSF4-204ENST00000462822 354 ntTSL 38.43□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.563e-15■■■■■ 28.4
PCBP2Q15366 AFG1L-203ENST00000430458 542 ntTSL 512.78□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 28.4
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