Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms