Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A8Q9Y2E8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9A8Q9Y2E8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A8Q9Y2E8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms