Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTNND2Q9UQB3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNND2Q9UQB3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNND2Q9UQB3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNND2Q9UQB3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNND2Q9UQB3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTNND2Q9UQB3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNND2Q9UQB3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTNND2Q9UQB3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CTNND2Q9UQB3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTNND2Q9UQB3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 409.2 ms