Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CTNND2Q9UQB3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CTNND2Q9UQB3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
CTNND2Q9UQB3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CTNND2Q9UQB3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CTNND2Q9UQB3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CTNND2Q9UQB3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CTNND2Q9UQB3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CTNND2Q9UQB3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CTNND2Q9UQB3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CTNND2Q9UQB3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CTNND2Q9UQB3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTNND2Q9UQB3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CTNND2Q9UQB3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTNND2Q9UQB3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CTNND2Q9UQB3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CTNND2Q9UQB3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CTNND2Q9UQB3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CTNND2Q9UQB3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CTNND2Q9UQB3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CTNND2Q9UQB3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CTNND2Q9UQB3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CTNND2Q9UQB3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CTNND2Q9UQB3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CTNND2Q9UQB3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CTNND2Q9UQB3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CTNND2Q9UQB3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CTNND2Q9UQB3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTNND2Q9UQB3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTNND2Q9UQB3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CTNND2Q9UQB3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CTNND2Q9UQB3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CTNND2Q9UQB3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTNND2Q9UQB3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CTNND2Q9UQB3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTNND2Q9UQB3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CTNND2Q9UQB3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CTNND2Q9UQB3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CTNND2Q9UQB3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CTNND2Q9UQB3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CTNND2Q9UQB3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CTNND2Q9UQB3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CTNND2Q9UQB3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CTNND2Q9UQB3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CTNND2Q9UQB3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CTNND2Q9UQB3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CTNND2Q9UQB3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CTNND2Q9UQB3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CTNND2Q9UQB3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CTNND2Q9UQB3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTNND2Q9UQB3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTNND2Q9UQB3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CTNND2Q9UQB3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CTNND2Q9UQB3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CTNND2Q9UQB3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CTNND2Q9UQB3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CTNND2Q9UQB3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CTNND2Q9UQB3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CTNND2Q9UQB3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CTNND2Q9UQB3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CTNND2Q9UQB3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CTNND2Q9UQB3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTNND2Q9UQB3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTNND2Q9UQB3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTNND2Q9UQB3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTNND2Q9UQB3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CTNND2Q9UQB3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CTNND2Q9UQB3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CTNND2Q9UQB3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CTNND2Q9UQB3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CTNND2Q9UQB3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CTNND2Q9UQB3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CTNND2Q9UQB3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CTNND2Q9UQB3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CTNND2Q9UQB3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CTNND2Q9UQB3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CTNND2Q9UQB3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CTNND2Q9UQB3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CTNND2Q9UQB3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CTNND2Q9UQB3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CTNND2Q9UQB3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CTNND2Q9UQB3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CTNND2Q9UQB3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CTNND2Q9UQB3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CTNND2Q9UQB3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CTNND2Q9UQB3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CTNND2Q9UQB3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CTNND2Q9UQB3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CTNND2Q9UQB3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CTNND2Q9UQB3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CTNND2Q9UQB3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTNND2Q9UQB3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CTNND2Q9UQB3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CTNND2Q9UQB3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CTNND2Q9UQB3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CTNND2Q9UQB3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CTNND2Q9UQB3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CTNND2Q9UQB3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CTNND2Q9UQB3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CTNND2Q9UQB3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms