Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHOC2Q9UQ13 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHOC2Q9UQ13 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHOC2Q9UQ13 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHOC2Q9UQ13 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHOC2Q9UQ13 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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