Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHOC2Q9UQ13 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHOC2Q9UQ13 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHOC2Q9UQ13 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHOC2Q9UQ13 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SHOC2Q9UQ13 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHOC2Q9UQ13 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHOC2Q9UQ13 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SHOC2Q9UQ13 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SHOC2Q9UQ13 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SHOC2Q9UQ13 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SHOC2Q9UQ13 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SHOC2Q9UQ13 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SHOC2Q9UQ13 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHOC2Q9UQ13 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHOC2Q9UQ13 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHOC2Q9UQ13 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHOC2Q9UQ13 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SHOC2Q9UQ13 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SHOC2Q9UQ13 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHOC2Q9UQ13 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHOC2Q9UQ13 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SHOC2Q9UQ13 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SHOC2Q9UQ13 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SHOC2Q9UQ13 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SHOC2Q9UQ13 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHOC2Q9UQ13 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHOC2Q9UQ13 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHOC2Q9UQ13 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHOC2Q9UQ13 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHOC2Q9UQ13 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SHOC2Q9UQ13 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHOC2Q9UQ13 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SHOC2Q9UQ13 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SHOC2Q9UQ13 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHOC2Q9UQ13 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHOC2Q9UQ13 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHOC2Q9UQ13 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHOC2Q9UQ13 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHOC2Q9UQ13 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SHOC2Q9UQ13 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SHOC2Q9UQ13 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHOC2Q9UQ13 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SHOC2Q9UQ13 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHOC2Q9UQ13 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHOC2Q9UQ13 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHOC2Q9UQ13 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SHOC2Q9UQ13 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHOC2Q9UQ13 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHOC2Q9UQ13 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHOC2Q9UQ13 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHOC2Q9UQ13 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHOC2Q9UQ13 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHOC2Q9UQ13 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHOC2Q9UQ13 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHOC2Q9UQ13 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHOC2Q9UQ13 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHOC2Q9UQ13 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SHOC2Q9UQ13 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHOC2Q9UQ13 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SHOC2Q9UQ13 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHOC2Q9UQ13 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHOC2Q9UQ13 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHOC2Q9UQ13 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHOC2Q9UQ13 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHOC2Q9UQ13 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHOC2Q9UQ13 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHOC2Q9UQ13 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SHOC2Q9UQ13 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SHOC2Q9UQ13 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SHOC2Q9UQ13 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SHOC2Q9UQ13 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHOC2Q9UQ13 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHOC2Q9UQ13 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHOC2Q9UQ13 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHOC2Q9UQ13 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHOC2Q9UQ13 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHOC2Q9UQ13 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHOC2Q9UQ13 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SHOC2Q9UQ13 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHOC2Q9UQ13 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHOC2Q9UQ13 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SHOC2Q9UQ13 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SHOC2Q9UQ13 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHOC2Q9UQ13 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHOC2Q9UQ13 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHOC2Q9UQ13 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHOC2Q9UQ13 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHOC2Q9UQ13 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SHOC2Q9UQ13 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHOC2Q9UQ13 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHOC2Q9UQ13 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SHOC2Q9UQ13 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SHOC2Q9UQ13 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SHOC2Q9UQ13 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHOC2Q9UQ13 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SHOC2Q9UQ13 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHOC2Q9UQ13 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SHOC2Q9UQ13 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SHOC2Q9UQ13 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
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