Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPSF2Q9P2I0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPSF2Q9P2I0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPSF2Q9P2I0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPSF2Q9P2I0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CPSF2Q9P2I0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPSF2Q9P2I0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPSF2Q9P2I0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPSF2Q9P2I0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms