Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4CQ9HCJ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4CQ9HCJ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4CQ9HCJ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4CQ9HCJ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC4CQ9HCJ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC4CQ9HCJ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC4CQ9HCJ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC4CQ9HCJ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4CQ9HCJ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4CQ9HCJ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4CQ9HCJ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC4CQ9HCJ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms