Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SRRTQ9BXP5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRRTQ9BXP5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRRTQ9BXP5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRRTQ9BXP5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRRTQ9BXP5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms