Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROX1Q92786 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROX1Q92786 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROX1Q92786 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms