Protein–RNA interactions for Protein: Q92552

MRPS27, 28S ribosomal protein S27, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS27Q92552 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRPS27Q92552 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRPS27Q92552 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRPS27Q92552 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRPS27Q92552 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRPS27Q92552 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MRPS27Q92552 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPS27Q92552 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPS27Q92552 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
MRPS27Q92552 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPS27Q92552 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms