Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLHC1Q8NHS4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLHC1Q8NHS4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLHC1Q8NHS4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms