Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HERPUD1Q15011 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERPUD1Q15011 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERPUD1Q15011 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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