Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERPUD1Q15011 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERPUD1Q15011 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HERPUD1Q15011 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HERPUD1Q15011 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HERPUD1Q15011 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HERPUD1Q15011 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERPUD1Q15011 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERPUD1Q15011 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HERPUD1Q15011 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERPUD1Q15011 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERPUD1Q15011 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERPUD1Q15011 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERPUD1Q15011 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERPUD1Q15011 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERPUD1Q15011 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERPUD1Q15011 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERPUD1Q15011 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERPUD1Q15011 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERPUD1Q15011 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERPUD1Q15011 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERPUD1Q15011 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERPUD1Q15011 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERPUD1Q15011 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERPUD1Q15011 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HERPUD1Q15011 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HERPUD1Q15011 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HERPUD1Q15011 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HERPUD1Q15011 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERPUD1Q15011 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERPUD1Q15011 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERPUD1Q15011 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERPUD1Q15011 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERPUD1Q15011 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERPUD1Q15011 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HERPUD1Q15011 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERPUD1Q15011 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERPUD1Q15011 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERPUD1Q15011 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERPUD1Q15011 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HERPUD1Q15011 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERPUD1Q15011 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERPUD1Q15011 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERPUD1Q15011 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERPUD1Q15011 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERPUD1Q15011 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERPUD1Q15011 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERPUD1Q15011 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERPUD1Q15011 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERPUD1Q15011 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERPUD1Q15011 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERPUD1Q15011 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERPUD1Q15011 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD1Q15011 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERPUD1Q15011 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERPUD1Q15011 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERPUD1Q15011 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HERPUD1Q15011 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HERPUD1Q15011 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HERPUD1Q15011 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HERPUD1Q15011 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HERPUD1Q15011 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HERPUD1Q15011 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HERPUD1Q15011 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERPUD1Q15011 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HERPUD1Q15011 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERPUD1Q15011 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HERPUD1Q15011 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HERPUD1Q15011 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HERPUD1Q15011 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERPUD1Q15011 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HERPUD1Q15011 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HERPUD1Q15011 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HERPUD1Q15011 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HERPUD1Q15011 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERPUD1Q15011 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERPUD1Q15011 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERPUD1Q15011 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERPUD1Q15011 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERPUD1Q15011 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERPUD1Q15011 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HERPUD1Q15011 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HERPUD1Q15011 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HERPUD1Q15011 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HERPUD1Q15011 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HERPUD1Q15011 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERPUD1Q15011 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERPUD1Q15011 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERPUD1Q15011 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERPUD1Q15011 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERPUD1Q15011 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERPUD1Q15011 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERPUD1Q15011 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERPUD1Q15011 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERPUD1Q15011 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERPUD1Q15011 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms