Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CSN1S1P47710 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSN1S1P47710 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSN1S1P47710 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSN1S1P47710 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms