Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSN1S1P47710 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSN1S1P47710 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSN1S1P47710 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSN1S1P47710 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSN1S1P47710 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSN1S1P47710 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSN1S1P47710 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CSN1S1P47710 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSN1S1P47710 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSN1S1P47710 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSN1S1P47710 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSN1S1P47710 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSN1S1P47710 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSN1S1P47710 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSN1S1P47710 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSN1S1P47710 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSN1S1P47710 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSN1S1P47710 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSN1S1P47710 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSN1S1P47710 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSN1S1P47710 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSN1S1P47710 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSN1S1P47710 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSN1S1P47710 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSN1S1P47710 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSN1S1P47710 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSN1S1P47710 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSN1S1P47710 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSN1S1P47710 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSN1S1P47710 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSN1S1P47710 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSN1S1P47710 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSN1S1P47710 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSN1S1P47710 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSN1S1P47710 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSN1S1P47710 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSN1S1P47710 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSN1S1P47710 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSN1S1P47710 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSN1S1P47710 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSN1S1P47710 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSN1S1P47710 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSN1S1P47710 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSN1S1P47710 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSN1S1P47710 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSN1S1P47710 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSN1S1P47710 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSN1S1P47710 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSN1S1P47710 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSN1S1P47710 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSN1S1P47710 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSN1S1P47710 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSN1S1P47710 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSN1S1P47710 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSN1S1P47710 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSN1S1P47710 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSN1S1P47710 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSN1S1P47710 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSN1S1P47710 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSN1S1P47710 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSN1S1P47710 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSN1S1P47710 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSN1S1P47710 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSN1S1P47710 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSN1S1P47710 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSN1S1P47710 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSN1S1P47710 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSN1S1P47710 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSN1S1P47710 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSN1S1P47710 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSN1S1P47710 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSN1S1P47710 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSN1S1P47710 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSN1S1P47710 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSN1S1P47710 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSN1S1P47710 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSN1S1P47710 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSN1S1P47710 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSN1S1P47710 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSN1S1P47710 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSN1S1P47710 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSN1S1P47710 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSN1S1P47710 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSN1S1P47710 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSN1S1P47710 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSN1S1P47710 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSN1S1P47710 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSN1S1P47710 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSN1S1P47710 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSN1S1P47710 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN1S1P47710 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSN1S1P47710 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSN1S1P47710 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSN1S1P47710 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSN1S1P47710 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSN1S1P47710 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSN1S1P47710 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSN1S1P47710 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSN1S1P47710 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms