Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AREGP15514 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AREGP15514 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AREGP15514 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AREGP15514 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AREGP15514 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AREGP15514 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AREGP15514 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AREGP15514 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AREGP15514 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AREGP15514 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AREGP15514 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AREGP15514 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AREGP15514 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AREGP15514 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AREGP15514 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AREGP15514 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AREGP15514 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AREGP15514 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AREGP15514 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AREGP15514 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AREGP15514 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AREGP15514 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AREGP15514 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AREGP15514 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AREGP15514 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AREGP15514 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AREGP15514 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AREGP15514 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AREGP15514 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AREGP15514 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AREGP15514 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AREGP15514 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AREGP15514 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
AREGP15514 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AREGP15514 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AREGP15514 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AREGP15514 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AREGP15514 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms