Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PLIN1O60240 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PLIN1O60240 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PLIN1O60240 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PLIN1O60240 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PLIN1O60240 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms