Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 UBC-212ENST00000544481 477 ntTSL 420.46■□□□□ 0.877e-46■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBC-202ENST00000535131 563 ntTSL 519.93■□□□□ 0.787e-46■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBC-209ENST00000541272 582 ntTSL 518.89■□□□□ 0.617e-46■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.53e-9■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 LMAN2-207ENST00000514458 616 ntTSL 532.45■■■□□ 2.783e-9■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.663e-9■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-6■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 FAM78A-202ENST00000372269 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.141e-6■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ARVCF-209ENST00000487793 863 ntTSL 227.27■■□□□ 1.962e-6■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ARVCF-210ENST00000492625 631 ntTSL 321.82■■□□□ 1.082e-6■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.765e-8■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.625e-8■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.515e-8■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 RBCK1-209ENST00000415942 2613 ntTSL 523.87■■□□□ 1.415e-8■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.225e-8■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 RBCK1-204ENST00000382214 2752 ntTSL 1 (best)22.34■■□□□ 1.175e-8■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 LARP4B-202ENST00000406525 681 ntTSL 541.46■■■■■ 4.232e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 LARP4B-207ENST00000476529 613 ntTSL 322.83■■□□□ 1.252e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 LARP4B-208ENST00000481118 421 ntTSL 319.93■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.62e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 222.87■■□□□ 1.252e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.22e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.58e-9■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.098e-9■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 234.85■■■■□ 3.179e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-206ENST00000585695 1121 ntTSL 234.85■■■■□ 3.179e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.179e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.939e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-216ENST00000592857 837 ntTSL 332.64■■■□□ 2.829e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.629e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-210ENST00000588315 1409 ntTSL 231.37■■■□□ 2.619e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-209ENST00000588049 839 ntTSL 530.59■■■□□ 2.499e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-204ENST00000585523 574 ntTSL 430.59■■■□□ 2.499e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.39e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-208ENST00000586633 566 ntTSL 327.81■■■□□ 2.049e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.519e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SLC25A39-214ENST00000591151 636 ntTSL 222.81■■□□□ 1.249e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-214ENST00000503282 584 ntTSL 233.58■■■□□ 2.971e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.841e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-229ENST00000510129 582 ntTSL 332.72■■■□□ 2.831e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-216ENST00000503742 1977 ntTSL 1 (best)31.93■■■□□ 2.71e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-220ENST00000505307 743 ntTSL 531.05■■■□□ 2.561e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-215ENST00000503418 662 ntTSL 430.08■■■□□ 2.411e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-213ENST00000502690 599 ntTSL 426.85■■□□□ 1.891e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-228ENST00000508974 568 ntTSL 422.78■■□□□ 1.241e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.211e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.511e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-232ENST00000514755 593 ntTSL 416.88■□□□□ 0.291e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-206ENST00000357194 660 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.111e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-227ENST00000508818 584 ntTSL 215.56■□□□□ 0.081e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-223ENST00000508249 604 ntTSL 415.07■□□□□ 01e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.011e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-208ENST00000394803 2227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-222ENST00000508238 547 ntTSL 412.23□□□□□ -0.451e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.741e-10■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ST3GAL2-205ENST00000567586 557 ntTSL 438.63■■■■□ 3.771e-6■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF444-202ENST00000586123 574 ntTSL 437.15■■■■□ 3.542e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF444-208ENST00000588358 642 ntTSL 235.02■■■■□ 3.22e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF444-203ENST00000587195 571 ntTSL 435.02■■■■□ 3.22e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF444-205ENST00000587467 646 ntTSL 234.97■■■■□ 3.192e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.162e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.742e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF444-212ENST00000593100 562 ntTSL 231.94■■■□□ 2.72e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 ZNF444-206ENST00000587664 568 ntTSL 331.74■■■□□ 2.672e-7■■■□□ 14.9
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DROSHAQ9NRR4 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 515□□□□□ -0.011e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 324.12■■□□□ 1.452e-12■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 222.84■■□□□ 1.253e-12■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-210ENST00000572721 841 ntTSL 221.68■■□□□ 1.063e-12■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SRRM2-211ENST00000572883 887 ntTSL 216.48■□□□□ 0.233e-12■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.719e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.175e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 AES-203ENST00000585557 491 ntTSL 543.55■■■■■ 4.569e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.236e-11■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 DNAJC6-207ENST00000494710 1621 ntTSL 537.99■■■■□ 3.675e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NUMBL-208ENST00000599594 393 ntTSL 537.24■■■■□ 3.555e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TPR-202ENST00000451586 515 ntTSL 237.23■■■■□ 3.555e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SLC2A4RG-203ENST00000474248 624 ntTSL 235.21■■■■□ 3.235e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SLC2A4RG-205ENST00000485897 518 ntTSL 534.39■■■■□ 3.15e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-205ENST00000525419 561 ntTSL 333.84■■■■□ 3.015e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NUMBL-206ENST00000598773 834 ntTSL 533.71■■■□□ 2.995e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 C1QTNF12-203ENST00000468365 647 ntTSL 332.61■■■□□ 2.815e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 VPS28-203ENST00000524521 564 ntTSL 1 (best)31.94■■■□□ 2.75e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.685e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.535e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 CLCN7-213ENST00000567836 647 ntTSL 230.79■■■□□ 2.525e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.475e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NRDC-211ENST00000491410 1020 ntTSL 230.43■■■□□ 2.465e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC5-205ENST00000587135 504 ntTSL 229.93■■■□□ 2.385e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-217ENST00000520254 579 ntTSL 429.07■■■□□ 2.245e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 AES-206ENST00000586742 1666 ntTSL 328.59■■■□□ 2.179e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC5-209ENST00000588703 445 ntTSL 327.75■■■□□ 2.035e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM229A-202ENST00000416512 2759 ntTSL 1 (best)27.7■■■□□ 2.025e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.015e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.985e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.985e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-208ENST00000526446 814 ntTSL 527.06■■□□□ 1.925e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.835e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ZFP36L1-206ENST00000557086 727 ntTSL 226.46■■□□□ 1.835e-6■■■□□ 14.8
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