RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.44■■■■■ 5.98
SLC25A39-216ENST00000592857 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.87■■■■■ 5.09
SLC25A39-216ENST00000592857 ABCC9O60706 1549 aa46.44■■■■■ 5.02
SLC25A39-216ENST00000592857 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.39■■■■■ 4.7
SLC25A39-216ENST00000592857 NACADO15069 1562 aa44.2■■■■■ 4.67
SLC25A39-216ENST00000592857 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.93■■■■■ 4.62
SLC25A39-216ENST00000592857 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.77■■■■■ 4.6
SLC25A39-216ENST00000592857 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
SLC25A39-216ENST00000592857 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.41■■■■■ 4.54
SLC25A39-216ENST00000592857 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.37■■■■■ 4.53
SLC25A39-216ENST00000592857 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.28■■■■■ 4.523e-6■■■□□ 15.6
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SLC25A39-216ENST00000592857 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.15■■■■■ 4.5
SLC25A39-216ENST00000592857 SCRIBQ14160 1630 aa42.72■■■■■ 4.43
SLC25A39-216ENST00000592857 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.59■■■■■ 4.41
SLC25A39-216ENST00000592857 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
SLC25A39-216ENST00000592857 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.98■■■■■ 4.31
SLC25A39-216ENST00000592857 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.79■■■■■ 4.28
SLC25A39-216ENST00000592857 NCAPD3P42695 1498 aa40.83■■■■■ 4.13
SLC25A39-216ENST00000592857 SMARCA4P51532 1647 aa40.82■■■■■ 4.12
SLC25A39-216ENST00000592857 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.76■■■■■ 4.12
SLC25A39-216ENST00000592857 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
SLC25A39-216ENST00000592857 SMARCA2P51531 1590 aa40.64■■■■■ 4.1
SLC25A39-216ENST00000592857 HMGXB3Q12766 1538 aa40.56■■■■■ 4.08
SLC25A39-216ENST00000592857 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.45■■■■■ 4.07
SLC25A39-216ENST00000592857 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.42■■■■■ 4.06
SLC25A39-216ENST00000592857 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
SLC25A39-216ENST00000592857 NESP48681 1621 aa40.04■■■■■ 4
SLC25A39-216ENST00000592857 ERCC6Q03468 1493 aa40.02■■■■■ 4
SLC25A39-216ENST00000592857 WIZO95785 1651 aa39.93■■■■□ 3.98
SLC25A39-216ENST00000592857 CUX2O14529 1486 aa39.86■■■■□ 3.97
SLC25A39-216ENST00000592857 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.8■■■■□ 3.96
SLC25A39-216ENST00000592857 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
SLC25A39-216ENST00000592857 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
SLC25A39-216ENST00000592857 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.58■■■■□ 3.93
SLC25A39-216ENST00000592857 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.54■■■■□ 3.92
SLC25A39-216ENST00000592857 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.53■■■■□ 3.92
SLC25A39-216ENST00000592857 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
SLC25A39-216ENST00000592857 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.34■■■■□ 3.89
SLC25A39-216ENST00000592857 CFTRP13569 1480 aa39.24■■■■□ 3.87
SLC25A39-216ENST00000592857 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.21■■■■□ 3.87
SLC25A39-216ENST00000592857 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.12■■■■□ 3.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.12■■■■□ 3.85
SLC25A39-216ENST00000592857 WDR62O43379 1518 aa39.12■■■■□ 3.85
SLC25A39-216ENST00000592857 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.01■■■■□ 3.84
SLC25A39-216ENST00000592857 PRDM2Q13029 1718 aa38.86■■■■□ 3.81
SLC25A39-216ENST00000592857 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
SLC25A39-216ENST00000592857 TOPBP1Q92547 1522 aa38.45■■■■□ 3.75
SLC25A39-216ENST00000592857 ABCC8Q09428 1581 aa38.35■■■■□ 3.73
SLC25A39-216ENST00000592857 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.34■■■■□ 3.73
SLC25A39-216ENST00000592857 IFT140Q96RY7 1462 aa38.34■■■■□ 3.73
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
SLC25A39-216ENST00000592857 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.18■■■■□ 3.7
SLC25A39-216ENST00000592857 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
SLC25A39-216ENST00000592857 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
SLC25A39-216ENST00000592857 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
SLC25A39-216ENST00000592857 OSCARQ8IYS5 282 aa38.05■■■■□ 3.68
SLC25A39-216ENST00000592857 CUX1P39880 1505 aa37.96■■■■□ 3.67
SLC25A39-216ENST00000592857 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.93■■■■□ 3.663e-8■■■■■ 38.5
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SLC25A39-216ENST00000592857 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.9■■■■□ 3.66
SLC25A39-216ENST00000592857 SOGA1O94964 1423 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC25A39-216ENST00000592857 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
SLC25A39-216ENST00000592857 TRIM41Q8WV44 630 aa37.73■■■■□ 3.63
SLC25A39-216ENST00000592857 WDR97A6NE52 1622 aa37.72■■■■□ 3.63
SLC25A39-216ENST00000592857 CHD1O14646 1710 aa37.67■■■■□ 3.62
SLC25A39-216ENST00000592857 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.58■■■■□ 3.61
SLC25A39-216ENST00000592857 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
SLC25A39-216ENST00000592857 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
SLC25A39-216ENST00000592857 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
SLC25A39-216ENST00000592857 GRIN2BQ13224 1484 aa37.52■■■■□ 3.6
SLC25A39-216ENST00000592857 FBLN2P98095 1184 aa37.51■■■■□ 3.6
SLC25A39-216ENST00000592857 ARHGEF11O15085 1522 aa37.51■■■■□ 3.59
SLC25A39-216ENST00000592857 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.51■■■■□ 3.59
SLC25A39-216ENST00000592857 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
SLC25A39-216ENST00000592857 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.45■■■■□ 3.59
SLC25A39-216ENST00000592857 TOP2BQ02880 1626 aa37.45■■■■□ 3.59
SLC25A39-216ENST00000592857 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.45■■■■□ 3.59
SLC25A39-216ENST00000592857 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.44■■■■□ 3.58
SLC25A39-216ENST00000592857 SYNJ1O43426 1573 aa37.43■■■■□ 3.58
SLC25A39-216ENST00000592857 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.43■■■■□ 3.58
SLC25A39-216ENST00000592857 PBRM1Q86U86 1689 aa37.41■■■■□ 3.58
SLC25A39-216ENST00000592857 SYNJ2O15056 1496 aa37.36■■■■□ 3.57
SLC25A39-216ENST00000592857 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
SLC25A39-216ENST00000592857 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.31■■■■□ 3.56
SLC25A39-216ENST00000592857 ARAP1Q96P48 1450 aa37.19■■■■□ 3.54
SLC25A39-216ENST00000592857 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.13■■■■□ 3.53
SLC25A39-216ENST00000592857 ADAMTS12P58397 1594 aa37.11■■■■□ 3.53
SLC25A39-216ENST00000592857 GRIN2AQ12879 1464 aa37.06■■■■□ 3.52
SLC25A39-216ENST00000592857 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.03■■■■□ 3.52
SLC25A39-216ENST00000592857 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.99■■■■□ 3.51
SLC25A39-216ENST00000592857 NUP160Q12769 1436 aa36.94■■■■□ 3.5
SLC25A39-216ENST00000592857 CEP170Q5SW79 1584 aa36.92■■■■□ 3.5
SLC25A39-216ENST00000592857 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.75■■■■□ 3.47
SLC25A39-216ENST00000592857 SHROOM2Q13796 1616 aa36.73■■■■□ 3.47
SLC25A39-216ENST00000592857 KIF27Q86VH2 1401 aa36.69■■■■□ 3.46
SLC25A39-216ENST00000592857 IGF1RP08069 1367 aa36.66■■■■□ 3.46
SLC25A39-216ENST00000592857 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.58■■■■□ 3.45
SLC25A39-216ENST00000592857 CUL7Q14999 1698 aa36.56■■■■□ 3.44
SLC25A39-216ENST00000592857 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
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