RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593100.5

ZNF444-212, Transcript of zinc finger protein 444, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF444, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444-212ENST00000593100 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.34■■■■■ 5.81
ZNF444-212ENST00000593100 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.9■■■■■ 4.94
ZNF444-212ENST00000593100 ABCC9O60706 1549 aa45.23■■■■■ 4.83
ZNF444-212ENST00000593100 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.36■■■■■ 4.53
ZNF444-212ENST00000593100 NACADO15069 1562 aa43.19■■■■■ 4.5
ZNF444-212ENST00000593100 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.08■■■■■ 4.49
ZNF444-212ENST00000593100 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.74■■■■■ 4.43
ZNF444-212ENST00000593100 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
ZNF444-212ENST00000593100 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.51■■■■■ 4.4
ZNF444-212ENST00000593100 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.44■■■■■ 4.38
ZNF444-212ENST00000593100 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.16■■■■■ 4.34
ZNF444-212ENST00000593100 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.05■■■■■ 4.32
ZNF444-212ENST00000593100 SCRIBQ14160 1630 aa41.86■■■■■ 4.29
ZNF444-212ENST00000593100 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.79■■■■■ 4.28
ZNF444-212ENST00000593100 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.51■■■■■ 4.24
ZNF444-212ENST00000593100 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
ZNF444-212ENST00000593100 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.93■■■■■ 4.14
ZNF444-212ENST00000593100 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.67■■■■■ 4.1
ZNF444-212ENST00000593100 SMARCA4P51532 1647 aa39.98■■■■□ 3.99
ZNF444-212ENST00000593100 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
ZNF444-212ENST00000593100 NCAPD3P42695 1498 aa39.8■■■■□ 3.96
ZNF444-212ENST00000593100 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.78■■■■□ 3.96
ZNF444-212ENST00000593100 SMARCA2P51531 1590 aa39.76■■■■□ 3.96
ZNF444-212ENST00000593100 HMGXB3Q12766 1538 aa39.62■■■■□ 3.93
ZNF444-212ENST00000593100 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.58■■■■□ 3.93
ZNF444-212ENST00000593100 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.55■■■■□ 3.92
ZNF444-212ENST00000593100 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
ZNF444-212ENST00000593100 WIZO95785 1651 aa39.2■■■■□ 3.87
ZNF444-212ENST00000593100 ERCC6Q03468 1493 aa39.04■■■■□ 3.84
ZNF444-212ENST00000593100 NESP48681 1621 aa39.03■■■■□ 3.84
ZNF444-212ENST00000593100 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
ZNF444-212ENST00000593100 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.89■■■■□ 3.82
ZNF444-212ENST00000593100 CUX2O14529 1486 aa38.72■■■■□ 3.79
ZNF444-212ENST00000593100 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
ZNF444-212ENST00000593100 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.66■■■■□ 3.78
ZNF444-212ENST00000593100 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.62■■■■□ 3.77
ZNF444-212ENST00000593100 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.59■■■■□ 3.77
ZNF444-212ENST00000593100 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
ZNF444-212ENST00000593100 CFTRP13569 1480 aa38.32■■■■□ 3.72
ZNF444-212ENST00000593100 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.24■■■■□ 3.71
ZNF444-212ENST00000593100 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.22■■■■□ 3.71
ZNF444-212ENST00000593100 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.22■■■■□ 3.71
ZNF444-212ENST00000593100 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.22■■■■□ 3.71
ZNF444-212ENST00000593100 PRDM2Q13029 1718 aa38.21■■■■□ 3.71
ZNF444-212ENST00000593100 WDR62O43379 1518 aa38.14■■■■□ 3.7
ZNF444-212ENST00000593100 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.93■■■■□ 3.66
ZNF444-212ENST00000593100 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
ZNF444-212ENST00000593100 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
ZNF444-212ENST00000593100 TOPBP1Q92547 1522 aa37.58■■■■□ 3.61
ZNF444-212ENST00000593100 ABCC8Q09428 1581 aa37.53■■■■□ 3.6
ZNF444-212ENST00000593100 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.52■■■■□ 3.6
ZNF444-212ENST00000593100 IFT140Q96RY7 1462 aa37.42■■■■□ 3.58
ZNF444-212ENST00000593100 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
ZNF444-212ENST00000593100 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
ZNF444-212ENST00000593100 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
ZNF444-212ENST00000593100 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
ZNF444-212ENST00000593100 CUX1P39880 1505 aa37.16■■■■□ 3.54
ZNF444-212ENST00000593100 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.09■■■■□ 3.53
ZNF444-212ENST00000593100 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.07■■■■□ 3.53
ZNF444-212ENST00000593100 SOGA1O94964 1423 aa37.05■■■■□ 3.52
ZNF444-212ENST00000593100 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.03■■■■□ 3.523e-6■□□□□ 10.3
ZNF444-212ENST00000593100 OSCARQ8IYS5 282 aa37.01■■■■□ 3.52
ZNF444-212ENST00000593100 WDR97A6NE52 1622 aa36.89■■■■□ 3.5
ZNF444-212ENST00000593100 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
ZNF444-212ENST00000593100 CHD1O14646 1710 aa36.87■■■■□ 3.49
ZNF444-212ENST00000593100 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.79■■■■□ 3.48
ZNF444-212ENST00000593100 TOP2BQ02880 1626 aa36.76■■■■□ 3.48
ZNF444-212ENST00000593100 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.76■■■■□ 3.47
ZNF444-212ENST00000593100 SYNJ1O43426 1573 aa36.74■■■■□ 3.47
ZNF444-212ENST00000593100 PBRM1Q86U86 1689 aa36.71■■■■□ 3.47
ZNF444-212ENST00000593100 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.7■■■■□ 3.47
ZNF444-212ENST00000593100 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.69■■■■□ 3.46
ZNF444-212ENST00000593100 FBLN2P98095 1184 aa36.69■■■■□ 3.46
ZNF444-212ENST00000593100 GRIN2BQ13224 1484 aa36.67■■■■□ 3.46
ZNF444-212ENST00000593100 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.63■■■■□ 3.45
ZNF444-212ENST00000593100 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.63■■■■□ 3.45
ZNF444-212ENST00000593100 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
ZNF444-212ENST00000593100 TRIM41Q8WV44 630 aa36.59■■■■□ 3.45
ZNF444-212ENST00000593100 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.57■■■■□ 3.44
ZNF444-212ENST00000593100 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.57■■■■□ 3.44
ZNF444-212ENST00000593100 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.57■■■■□ 3.44
ZNF444-212ENST00000593100 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
ZNF444-212ENST00000593100 SYNJ2O15056 1496 aa36.49■■■■□ 3.43
ZNF444-212ENST00000593100 ARHGEF11O15085 1522 aa36.47■■■■□ 3.43
ZNF444-212ENST00000593100 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.35■■■■□ 3.41
ZNF444-212ENST00000593100 ADAMTS12P58397 1594 aa36.32■■■■□ 3.4
ZNF444-212ENST00000593100 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.26■■■■□ 3.4
ZNF444-212ENST00000593100 GRIN2AQ12879 1464 aa36.22■■■■□ 3.39
ZNF444-212ENST00000593100 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.17■■■■□ 3.38
ZNF444-212ENST00000593100 ARAP1Q96P48 1450 aa36.14■■■■□ 3.38
ZNF444-212ENST00000593100 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.13■■■■□ 3.37
ZNF444-212ENST00000593100 CEP170Q5SW79 1584 aa36.09■■■■□ 3.37
ZNF444-212ENST00000593100 NUP160Q12769 1436 aa36.03■■■■□ 3.36
ZNF444-212ENST00000593100 KIF27Q86VH2 1401 aa36.02■■■■□ 3.36
ZNF444-212ENST00000593100 CUL7Q14999 1698 aa35.92■■■■□ 3.34
ZNF444-212ENST00000593100 IGF1RP08069 1367 aa35.88■■■■□ 3.33
ZNF444-212ENST00000593100 SHROOM2Q13796 1616 aa35.87■■■■□ 3.33
ZNF444-212ENST00000593100 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.84■■■■□ 3.33
ZNF444-212ENST00000593100 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.79■■■■□ 3.32
ZNF444-212ENST00000593100 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.68■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms