Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FANCCQ00597 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms