RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404223.5

GGT1-206, Transcript of gamma-glutamyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGT1, Length 952 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGT1-206ENST00000404223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.39■■■■■ 5.34
GGT1-206ENST00000404223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.97■■■■■ 4.47
GGT1-206ENST00000404223 ABCC9O60706 1549 aa42■■■■■ 4.31
GGT1-206ENST00000404223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.39■■■■■ 4.06
GGT1-206ENST00000404223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.39■■■■■ 4.06
GGT1-206ENST00000404223 NACADO15069 1562 aa40.38■■■■■ 4.05
GGT1-206ENST00000404223 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
GGT1-206ENST00000404223 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.19■■■■■ 4.02
GGT1-206ENST00000404223 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.07■■■■■ 4.01
GGT1-206ENST00000404223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.39■■■■□ 3.9
GGT1-206ENST00000404223 SCRIBQ14160 1630 aa39.21■■■■□ 3.87
GGT1-206ENST00000404223 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.16■■■■□ 3.863e-8■■■■□ 26.7
GGT1-206ENST00000404223 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.08■■■■□ 3.85
GGT1-206ENST00000404223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.87■■■■□ 3.81
GGT1-206ENST00000404223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.79■■■■□ 3.8
GGT1-206ENST00000404223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.08■■■■□ 3.69
GGT1-206ENST00000404223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.96■■■■□ 3.67
GGT1-206ENST00000404223 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.75■■■■□ 3.63
GGT1-206ENST00000404223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
GGT1-206ENST00000404223 SMARCA4P51532 1647 aa37.52■■■■□ 3.6
GGT1-206ENST00000404223 SMARCA2P51531 1590 aa37.28■■■■□ 3.56
GGT1-206ENST00000404223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.27■■■■□ 3.56
GGT1-206ENST00000404223 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.27■■■■□ 3.56
GGT1-206ENST00000404223 NCAPD3P42695 1498 aa37.24■■■■□ 3.55
GGT1-206ENST00000404223 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.16■■■■□ 3.54
GGT1-206ENST00000404223 HMGXB3Q12766 1538 aa37.09■■■■□ 3.53
GGT1-206ENST00000404223 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
GGT1-206ENST00000404223 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
GGT1-206ENST00000404223 WIZO95785 1651 aa36.88■■■■□ 3.49
GGT1-206ENST00000404223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
GGT1-206ENST00000404223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.25■■■■□ 3.39
GGT1-206ENST00000404223 NESP48681 1621 aa36.25■■■■□ 3.39
GGT1-206ENST00000404223 ERCC6Q03468 1493 aa36.24■■■■□ 3.39
GGT1-206ENST00000404223 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.17■■■■□ 3.38
GGT1-206ENST00000404223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
GGT1-206ENST00000404223 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.09■■■■□ 3.37
GGT1-206ENST00000404223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.02■■■■□ 3.36
GGT1-206ENST00000404223 CFTRP13569 1480 aa35.99■■■■□ 3.35
GGT1-206ENST00000404223 CUX2O14529 1486 aa35.93■■■■□ 3.34
GGT1-206ENST00000404223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.84■■■■□ 3.33
GGT1-206ENST00000404223 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
GGT1-206ENST00000404223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.76■■■■□ 3.32
GGT1-206ENST00000404223 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.72■■■■□ 3.31
GGT1-206ENST00000404223 PRDM2Q13029 1718 aa35.71■■■■□ 3.31
GGT1-206ENST00000404223 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.62■■■■□ 3.29
GGT1-206ENST00000404223 WDR62O43379 1518 aa35.48■■■■□ 3.27
GGT1-206ENST00000404223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
GGT1-206ENST00000404223 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.29■■■■□ 3.24
GGT1-206ENST00000404223 ABCC8Q09428 1581 aa35.25■■■■□ 3.23
GGT1-206ENST00000404223 TOPBP1Q92547 1522 aa35.19■■■■□ 3.22
GGT1-206ENST00000404223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.18■■■■□ 3.22
GGT1-206ENST00000404223 CUX1P39880 1505 aa34.96■■■■□ 3.19
GGT1-206ENST00000404223 IFT140Q96RY7 1462 aa34.96■■■■□ 3.19
GGT1-206ENST00000404223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
GGT1-206ENST00000404223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.85■■■■□ 3.17
GGT1-206ENST00000404223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.84■■■■□ 3.17
GGT1-206ENST00000404223 SOGA1O94964 1423 aa34.78■■■■□ 3.16
GGT1-206ENST00000404223 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
GGT1-206ENST00000404223 TOP2BQ02880 1626 aa34.74■■■■□ 3.15
GGT1-206ENST00000404223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.73■■■■□ 3.15
GGT1-206ENST00000404223 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
GGT1-206ENST00000404223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.72■■■■□ 3.15
GGT1-206ENST00000404223 SYNJ1O43426 1573 aa34.7■■■■□ 3.15
GGT1-206ENST00000404223 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
GGT1-206ENST00000404223 WDR97A6NE52 1622 aa34.58■■■■□ 3.13
GGT1-206ENST00000404223 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.57■■■■□ 3.12
GGT1-206ENST00000404223 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
GGT1-206ENST00000404223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.52■■■■□ 3.12
GGT1-206ENST00000404223 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.39■■■■□ 3.1
GGT1-206ENST00000404223 GRIN2BQ13224 1484 aa34.37■■■■□ 3.09
GGT1-206ENST00000404223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.36■■■■□ 3.09
GGT1-206ENST00000404223 OSCARQ8IYS5 282 aa34.35■■■■□ 3.09
GGT1-206ENST00000404223 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.28■■■■□ 3.08
GGT1-206ENST00000404223 PBRM1Q86U86 1689 aa34.28■■■■□ 3.08
GGT1-206ENST00000404223 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
GGT1-206ENST00000404223 FBLN2P98095 1184 aa34.17■■■■□ 3.06
GGT1-206ENST00000404223 TRIM41Q8WV44 630 aa34.15■■■■□ 3.06
GGT1-206ENST00000404223 CHD1O14646 1710 aa34.15■■■■□ 3.06
GGT1-206ENST00000404223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.13■■■■□ 3.05
GGT1-206ENST00000404223 SYNJ2O15056 1496 aa34.13■■■■□ 3.05
GGT1-206ENST00000404223 KIF27Q86VH2 1401 aa34.13■■■■□ 3.05
GGT1-206ENST00000404223 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
GGT1-206ENST00000404223 ADAMTS12P58397 1594 aa34.03■■■■□ 3.04
GGT1-206ENST00000404223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34■■■■□ 3.03
GGT1-206ENST00000404223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.94■■■■□ 3.02
GGT1-206ENST00000404223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.94■■■■□ 3.02
GGT1-206ENST00000404223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.94■■■■□ 3.02
GGT1-206ENST00000404223 IGF1RP08069 1367 aa33.92■■■■□ 3.02
GGT1-206ENST00000404223 GRIN2AQ12879 1464 aa33.91■■■■□ 3.02
GGT1-206ENST00000404223 CUL7Q14999 1698 aa33.87■■■■□ 3.01
GGT1-206ENST00000404223 ARHGEF11O15085 1522 aa33.86■■■■□ 3.01
GGT1-206ENST00000404223 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.79■■■■□ 3
GGT1-206ENST00000404223 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.79■■■■□ 3
GGT1-206ENST00000404223 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.77■■■■□ 3
GGT1-206ENST00000404223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.74■■■□□ 2.99
GGT1-206ENST00000404223 NUP160Q12769 1436 aa33.74■■■□□ 2.99
GGT1-206ENST00000404223 CEP170Q5SW79 1584 aa33.71■■■□□ 2.99
GGT1-206ENST00000404223 EEA1Q15075 1411 aa33.6■■■□□ 2.97
GGT1-206ENST00000404223 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.57■■■□□ 2.97
GGT1-206ENST00000404223 ARAP1Q96P48 1450 aa33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms