RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442166.2

PCOLCE-AS1-201, PCOLCE antisense RNA 1, humanhuman

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Gene PCOLCE-AS1, Length 2,537 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.72■■■■■ 4.11
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.08■■■■□ 3.21
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34■■■■□ 3.03
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.77■■■■□ 3
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.48■■■□□ 2.95
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ABCC9O60706 1549 aa32.98■■■□□ 2.87
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.81■■■□□ 2.84
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SCRIBQ14160 1630 aa32.63■■■□□ 2.81
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NACADO15069 1562 aa32.55■■■□□ 2.8
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.17■■■□□ 2.74
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.77■■■□□ 2.68
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.77■■■□□ 2.68
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.74■■■□□ 2.67
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.6■■■□□ 2.65
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 WIZO95785 1651 aa31.41■■■□□ 2.62
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.34■■■□□ 2.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.32■■■□□ 2.6
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SMARCA4P51532 1647 aa31.2■■■□□ 2.59
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TRIM41Q8WV44 630 aa30.79■■■□□ 2.52
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SMARCA2P51531 1590 aa30.73■■■□□ 2.51
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.72■■■□□ 2.51
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.72■■■□□ 2.51
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.67■■■□□ 2.5
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.54■■■□□ 2.48
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ABCC8Q09428 1581 aa30.4■■■□□ 2.46
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.17■■■□□ 2.42
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NCAPD3P42695 1498 aa30.1■■■□□ 2.41
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 HMGXB3Q12766 1538 aa30.07■■■□□ 2.4
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SOGA1O94964 1423 aa29.93■■■□□ 2.38
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 SYNJ1O43426 1573 aa29.9■■■□□ 2.38
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.9■■■□□ 2.38
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.83■■■□□ 2.37
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.77■■■□□ 2.36
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 EEA1Q15075 1411 aa29.67■■■□□ 2.34
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.66■■■□□ 2.34
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CFTRP13569 1480 aa29.64■■■□□ 2.33
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TOP2BQ02880 1626 aa29.62■■■□□ 2.33
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.55■■■□□ 2.32
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PRDM2Q13029 1718 aa29.48■■■□□ 2.31
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CUX1P39880 1505 aa29.48■■■□□ 2.31
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.44■■■□□ 2.3
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CEP162Q5TB80 1403 aa29.43■■■□□ 2.3
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.42■■■□□ 2.3
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 GOLGA3Q08378 1498 aa29.42■■■□□ 2.3
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 HRCP23327 699 aa29.38■■■□□ 2.29
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KIF21BO75037 1637 aa29.36■■■□□ 2.29
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.35■■■□□ 2.29
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.26■■■□□ 2.27
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 NESP48681 1621 aa29.18■■■□□ 2.26
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.15■■■□□ 2.26
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.14■■■□□ 2.26
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KIF27Q86VH2 1401 aa29.1■■■□□ 2.25
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PRXQ9BXM0 1461 aa29.08■■■□□ 2.25
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.06■■■□□ 2.24
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CLIP1P30622 1438 aa29.04■■■□□ 2.24
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.02■■■□□ 2.24
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CUX2O14529 1486 aa28.99■■■□□ 2.23
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.96■■■□□ 2.23
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.92■■■□□ 2.22
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TOPBP1Q92547 1522 aa28.89■■■□□ 2.22
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 IGF1RP08069 1367 aa28.86■■■□□ 2.21
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.83■■■□□ 2.21
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.83■■■□□ 2.21
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.75■■■□□ 2.19
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.73■■■□□ 2.19
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.72■■■□□ 2.19
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.72■■■□□ 2.19
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ARAP1Q96P48 1450 aa28.7■■■□□ 2.19
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 WDR97A6NE52 1622 aa28.6■■■□□ 2.17
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.59■■■□□ 2.17
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 APLP2Q06481 763 aa28.57■■■□□ 2.16
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.46■■■□□ 2.15
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CUL7Q14999 1698 aa28.46■■■□□ 2.15
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.4■■■□□ 2.14
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.36■■■□□ 2.13
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.32■■■□□ 2.12
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 P3H3Q8IVL6 736 aa28.29■■■□□ 2.12
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