Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
FANCCQ00597 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FANCCQ00597 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FANCCQ00597 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FANCCQ00597 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FANCCQ00597 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
FANCCQ00597 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FANCCQ00597 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FANCCQ00597 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCCQ00597 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FANCCQ00597 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FANCCQ00597 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FANCCQ00597 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
FANCCQ00597 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FANCCQ00597 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
FANCCQ00597 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
FANCCQ00597 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FANCCQ00597 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCCQ00597 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCCQ00597 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FANCCQ00597 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FANCCQ00597 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FANCCQ00597 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
FANCCQ00597 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCCQ00597 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FANCCQ00597 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FANCCQ00597 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FANCCQ00597 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FANCCQ00597 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
FANCCQ00597 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCCQ00597 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FANCCQ00597 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FANCCQ00597 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FANCCQ00597 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FANCCQ00597 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FANCCQ00597 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FANCCQ00597 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FANCCQ00597 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
FANCCQ00597 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
FANCCQ00597 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FANCCQ00597 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FANCCQ00597 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCCQ00597 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FANCCQ00597 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FANCCQ00597 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FANCCQ00597 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FANCCQ00597 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
FANCCQ00597 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCCQ00597 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FANCCQ00597 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
FANCCQ00597 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
FANCCQ00597 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FANCCQ00597 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
FANCCQ00597 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FANCCQ00597 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FANCCQ00597 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FANCCQ00597 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FANCCQ00597 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FANCCQ00597 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
FANCCQ00597 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FANCCQ00597 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FANCCQ00597 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
FANCCQ00597 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FANCCQ00597 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FANCCQ00597 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FANCCQ00597 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FANCCQ00597 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FANCCQ00597 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FANCCQ00597 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FANCCQ00597 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FANCCQ00597 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FANCCQ00597 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FANCCQ00597 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FANCCQ00597 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FANCCQ00597 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FANCCQ00597 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FANCCQ00597 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FANCCQ00597 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FANCCQ00597 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FANCCQ00597 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
FANCCQ00597 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FANCCQ00597 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FANCCQ00597 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FANCCQ00597 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FANCCQ00597 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FANCCQ00597 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCCQ00597 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCCQ00597 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCCQ00597 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCCQ00597 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCCQ00597 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCCQ00597 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FANCCQ00597 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FANCCQ00597 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCCQ00597 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FANCCQ00597 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FANCCQ00597 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FANCCQ00597 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FANCCQ00597 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FANCCQ00597 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms