RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.93■■■■□ 3.98
CLN8-211ENST00000636934 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.46■■■■□ 3.11
CLN8-211ENST00000636934 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.98
CLN8-211ENST00000636934 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.14■■■□□ 2.9
CLN8-211ENST00000636934 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.03■■■□□ 2.88
CLN8-211ENST00000636934 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.78■■■□□ 2.84
CLN8-211ENST00000636934 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.35■■■□□ 2.77
CLN8-211ENST00000636934 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
CLN8-211ENST00000636934 NACADO15069 1562 aa31.93■■■□□ 2.7
CLN8-211ENST00000636934 ABCC9O60706 1549 aa31.88■■■□□ 2.69
CLN8-211ENST00000636934 SCRIBQ14160 1630 aa31.8■■■□□ 2.68
CLN8-211ENST00000636934 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.48■■■□□ 2.63
CLN8-211ENST00000636934 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.32■■■□□ 2.6
CLN8-211ENST00000636934 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CLN8-211ENST00000636934 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.93■■■□□ 2.54
CLN8-211ENST00000636934 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.86■■■□□ 2.53
CLN8-211ENST00000636934 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.8■■■□□ 2.52
CLN8-211ENST00000636934 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CLN8-211ENST00000636934 WIZO95785 1651 aa30.65■■■□□ 2.5
CLN8-211ENST00000636934 SMARCA4P51532 1647 aa30.53■■■□□ 2.48
CLN8-211ENST00000636934 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.45■■■□□ 2.46
CLN8-211ENST00000636934 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
CLN8-211ENST00000636934 TRIM41Q8WV44 630 aa30.35■■■□□ 2.45
CLN8-211ENST00000636934 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.23■■■□□ 2.43
CLN8-211ENST00000636934 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CLN8-211ENST00000636934 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.13■■■□□ 2.41
CLN8-211ENST00000636934 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.12■■■□□ 2.41
CLN8-211ENST00000636934 SMARCA2P51531 1590 aa30.11■■■□□ 2.41
CLN8-211ENST00000636934 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.08■■■□□ 2.41
CLN8-211ENST00000636934 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.83■■■□□ 2.37
CLN8-211ENST00000636934 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CLN8-211ENST00000636934 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CLN8-211ENST00000636934 ABCC8Q09428 1581 aa29.69■■■□□ 2.34
CLN8-211ENST00000636934 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.64■■■□□ 2.34
CLN8-211ENST00000636934 EEA1Q15075 1411 aa29.49■■■□□ 2.31
CLN8-211ENST00000636934 HMGXB3Q12766 1538 aa29.48■■■□□ 2.31
CLN8-211ENST00000636934 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CLN8-211ENST00000636934 HRCP23327 699 aa29.45■■■□□ 2.31
CLN8-211ENST00000636934 NCAPD3P42695 1498 aa29.45■■■□□ 2.3
CLN8-211ENST00000636934 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.3
CLN8-211ENST00000636934 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.31■■■□□ 2.28
CLN8-211ENST00000636934 SOGA1O94964 1423 aa29.3■■■□□ 2.28
CLN8-211ENST00000636934 SYNJ1O43426 1573 aa29.25■■■□□ 2.27
CLN8-211ENST00000636934 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.22■■■□□ 2.27
CLN8-211ENST00000636934 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.15■■■□□ 2.26
CLN8-211ENST00000636934 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.11■■■□□ 2.25
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA3Q08378 1498 aa29.1■■■□□ 2.25
CLN8-211ENST00000636934 TOP2BQ02880 1626 aa29.1■■■□□ 2.25
CLN8-211ENST00000636934 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.05■■■□□ 2.24
CLN8-211ENST00000636934 CEP162Q5TB80 1403 aa29.04■■■□□ 2.24
CLN8-211ENST00000636934 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.02■■■□□ 2.24
CLN8-211ENST00000636934 KIF21BO75037 1637 aa29.02■■■□□ 2.24
CLN8-211ENST00000636934 CFTRP13569 1480 aa29.01■■■□□ 2.23
CLN8-211ENST00000636934 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CLN8-211ENST00000636934 PRDM2Q13029 1718 aa28.92■■■□□ 2.22
CLN8-211ENST00000636934 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.86■■■□□ 2.21
CLN8-211ENST00000636934 CUX1P39880 1505 aa28.81■■■□□ 2.2
CLN8-211ENST00000636934 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CLN8-211ENST00000636934 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.77■■■□□ 2.2
CLN8-211ENST00000636934 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.69■■■□□ 2.18
CLN8-211ENST00000636934 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.67■■■□□ 2.18
CLN8-211ENST00000636934 KIF27Q86VH2 1401 aa28.66■■■□□ 2.18
CLN8-211ENST00000636934 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CLN8-211ENST00000636934 CLIP1P30622 1438 aa28.65■■■□□ 2.18
CLN8-211ENST00000636934 PRXQ9BXM0 1461 aa28.62■■■□□ 2.17
CLN8-211ENST00000636934 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.51■■■□□ 2.15
CLN8-211ENST00000636934 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.45■■■□□ 2.14
CLN8-211ENST00000636934 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.39■■■□□ 2.14
CLN8-211ENST00000636934 CUX2O14529 1486 aa28.38■■■□□ 2.13
CLN8-211ENST00000636934 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.35■■■□□ 2.13
CLN8-211ENST00000636934 APLP2Q06481 763 aa28.34■■■□□ 2.13
CLN8-211ENST00000636934 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.34■■■□□ 2.13
CLN8-211ENST00000636934 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CLN8-211ENST00000636934 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.28■■■□□ 2.12
CLN8-211ENST00000636934 IGF1RP08069 1367 aa28.27■■■□□ 2.12
CLN8-211ENST00000636934 ARAP1Q96P48 1450 aa28.23■■■□□ 2.11
CLN8-211ENST00000636934 TOPBP1Q92547 1522 aa28.22■■■□□ 2.11
CLN8-211ENST00000636934 NESP48681 1621 aa28.21■■■□□ 2.11
CLN8-211ENST00000636934 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
CLN8-211ENST00000636934 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CLN8-211ENST00000636934 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.17■■■□□ 2.1
CLN8-211ENST00000636934 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.17■■■□□ 2.1
CLN8-211ENST00000636934 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
CLN8-211ENST00000636934 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CLN8-211ENST00000636934 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.12■■■□□ 2.09
CLN8-211ENST00000636934 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.08■■■□□ 2.09
CLN8-211ENST00000636934 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.05■■■□□ 2.08
CLN8-211ENST00000636934 CUL7Q14999 1698 aa28.03■■■□□ 2.08
CLN8-211ENST00000636934 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CLN8-211ENST00000636934 WDR97A6NE52 1622 aa27.97■■■□□ 2.07
CLN8-211ENST00000636934 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.89■■■□□ 2.06
CLN8-211ENST00000636934 MAP3K1Q13233 1512 aa27.89■■■□□ 2.06
CLN8-211ENST00000636934 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.86■■■□□ 2.05
CLN8-211ENST00000636934 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
CLN8-211ENST00000636934 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.85■■■□□ 2.05
CLN8-211ENST00000636934 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.84■■■□□ 2.05
CLN8-211ENST00000636934 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.81■■■□□ 2.04
CLN8-211ENST00000636934 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CLN8-211ENST00000636934 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.79■■■□□ 2.04
CLN8-211ENST00000636934 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms