RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.64■■■■■ 5.7
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.16■■■■■ 4.82
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC9O60706 1549 aa44.5■■■■■ 4.71
UBE2E3-201ENST00000392415 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.66■■■■■ 4.42
UBE2E3-201ENST00000392415 NACADO15069 1562 aa42.56■■■■■ 4.4
UBE2E3-201ENST00000392415 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.42■■■■■ 4.38
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.21■■■■■ 4.35
UBE2E3-201ENST00000392415 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
UBE2E3-201ENST00000392415 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.9■■■■■ 4.3
UBE2E3-201ENST00000392415 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.72■■■■■ 4.27
UBE2E3-201ENST00000392415 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.53■■■■■ 4.24
UBE2E3-201ENST00000392415 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.41■■■■■ 4.22
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.18■■■■■ 4.18
UBE2E3-201ENST00000392415 SCRIBQ14160 1630 aa41.15■■■■■ 4.18
UBE2E3-201ENST00000392415 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.94■■■■■ 4.14
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.25■■■■■ 4.03
UBE2E3-201ENST00000392415 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.03■■■■■ 4
UBE2E3-201ENST00000392415 SMARCA4P51532 1647 aa39.36■■■■□ 3.89
UBE2E3-201ENST00000392415 NCAPD3P42695 1498 aa39.29■■■■□ 3.88
UBE2E3-201ENST00000392415 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
UBE2E3-201ENST00000392415 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.24■■■■□ 3.87
UBE2E3-201ENST00000392415 SMARCA2P51531 1590 aa39.17■■■■□ 3.86
UBE2E3-201ENST00000392415 HMGXB3Q12766 1538 aa39.04■■■■□ 3.84
UBE2E3-201ENST00000392415 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.01■■■■□ 3.84
UBE2E3-201ENST00000392415 PEG3Q9GZU2 1588 aa39■■■■□ 3.83
UBE2E3-201ENST00000392415 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
UBE2E3-201ENST00000392415 WIZO95785 1651 aa38.57■■■■□ 3.77
UBE2E3-201ENST00000392415 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
UBE2E3-201ENST00000392415 NESP48681 1621 aa38.41■■■■□ 3.74
UBE2E3-201ENST00000392415 ERCC6Q03468 1493 aa38.37■■■■□ 3.73
UBE2E3-201ENST00000392415 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.29■■■■□ 3.72
UBE2E3-201ENST00000392415 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.7
UBE2E3-201ENST00000392415 CUX2O14529 1486 aa38.11■■■■□ 3.69
UBE2E3-201ENST00000392415 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.11■■■■□ 3.69
UBE2E3-201ENST00000392415 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.04■■■■□ 3.68
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.96■■■■□ 3.67
UBE2E3-201ENST00000392415 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
UBE2E3-201ENST00000392415 CFTRP13569 1480 aa37.82■■■■□ 3.65
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.7■■■■□ 3.63
UBE2E3-201ENST00000392415 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.66■■■■□ 3.62
UBE2E3-201ENST00000392415 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.66■■■■□ 3.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.64■■■■□ 3.62
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR62O43379 1518 aa37.55■■■■□ 3.6
UBE2E3-201ENST00000392415 PRDM2Q13029 1718 aa37.5■■■■□ 3.59
UBE2E3-201ENST00000392415 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.36■■■■□ 3.57
UBE2E3-201ENST00000392415 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
UBE2E3-201ENST00000392415 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
UBE2E3-201ENST00000392415 TOPBP1Q92547 1522 aa37.02■■■■□ 3.52
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCC8Q09428 1581 aa37.02■■■■□ 3.52
UBE2E3-201ENST00000392415 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.95■■■■□ 3.51
UBE2E3-201ENST00000392415 IFT140Q96RY7 1462 aa36.87■■■■□ 3.49
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
UBE2E3-201ENST00000392415 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
UBE2E3-201ENST00000392415 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
UBE2E3-201ENST00000392415 CUX1P39880 1505 aa36.61■■■■□ 3.45
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
UBE2E3-201ENST00000392415 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.54■■■■□ 3.44
UBE2E3-201ENST00000392415 SOGA1O94964 1423 aa36.53■■■■□ 3.44
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.52■■■■□ 3.44
UBE2E3-201ENST00000392415 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.48■■■■□ 3.43
UBE2E3-201ENST00000392415 OSCARQ8IYS5 282 aa36.48■■■■□ 3.43
UBE2E3-201ENST00000392415 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR97A6NE52 1622 aa36.35■■■■□ 3.41
UBE2E3-201ENST00000392415 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.39
UBE2E3-201ENST00000392415 TOP2BQ02880 1626 aa36.22■■■■□ 3.39
UBE2E3-201ENST00000392415 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.22■■■■□ 3.39
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.19■■■■□ 3.38
UBE2E3-201ENST00000392415 SYNJ1O43426 1573 aa36.18■■■■□ 3.38
UBE2E3-201ENST00000392415 CHD1O14646 1710 aa36.17■■■■□ 3.38
UBE2E3-201ENST00000392415 GRIN2BQ13224 1484 aa36.14■■■■□ 3.38
UBE2E3-201ENST00000392415 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.12■■■■□ 3.37
UBE2E3-201ENST00000392415 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.1■■■■□ 3.37
UBE2E3-201ENST00000392415 FBLN2P98095 1184 aa36.09■■■■□ 3.37
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.07■■■■□ 3.36
UBE2E3-201ENST00000392415 PBRM1Q86U86 1689 aa36.04■■■■□ 3.36
UBE2E3-201ENST00000392415 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
UBE2E3-201ENST00000392415 SYNJ2O15056 1496 aa35.95■■■■□ 3.35
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM41Q8WV44 630 aa35.94■■■■□ 3.34
UBE2E3-201ENST00000392415 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.92■■■■□ 3.34
UBE2E3-201ENST00000392415 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.92■■■■□ 3.34
UBE2E3-201ENST00000392415 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.92■■■■□ 3.34
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGEF11O15085 1522 aa35.88■■■■□ 3.33
UBE2E3-201ENST00000392415 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.78■■■■□ 3.32
UBE2E3-201ENST00000392415 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.74■■■■□ 3.31
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAMTS12P58397 1594 aa35.72■■■■□ 3.31
UBE2E3-201ENST00000392415 GRIN2AQ12879 1464 aa35.68■■■■□ 3.3
UBE2E3-201ENST00000392415 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.67■■■■□ 3.3
UBE2E3-201ENST00000392415 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.57■■■■□ 3.29
UBE2E3-201ENST00000392415 ARAP1Q96P48 1450 aa35.57■■■■□ 3.28
UBE2E3-201ENST00000392415 NUP160Q12769 1436 aa35.55■■■■□ 3.28
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF27Q86VH2 1401 aa35.52■■■■□ 3.28
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP170Q5SW79 1584 aa35.51■■■■□ 3.28
UBE2E3-201ENST00000392415 IGF1RP08069 1367 aa35.44■■■■□ 3.26
UBE2E3-201ENST00000392415 CUL7Q14999 1698 aa35.34■■■■□ 3.25
UBE2E3-201ENST00000392415 SHROOM2Q13796 1616 aa35.31■■■■□ 3.24
UBE2E3-201ENST00000392415 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.26■■■■□ 3.23
UBE2E3-201ENST00000392415 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.21■■■■□ 3.23
UBE2E3-201ENST00000392415 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.5 ms