Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI43

MRM2, rRNA methyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM2Q9UI43 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRM2Q9UI43 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRM2Q9UI43 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRM2Q9UI43 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRM2Q9UI43 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRM2Q9UI43 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRM2Q9UI43 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRM2Q9UI43 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRM2Q9UI43 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRM2Q9UI43 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRM2Q9UI43 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRM2Q9UI43 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRM2Q9UI43 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRM2Q9UI43 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms