Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZNHIT6Q9NWK9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNHIT6Q9NWK9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNHIT6Q9NWK9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNHIT6Q9NWK9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNHIT6Q9NWK9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms