Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FANCLQ9NW38 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FANCLQ9NW38 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FANCLQ9NW38 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCLQ9NW38 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FANCLQ9NW38 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FANCLQ9NW38 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms