Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRTAC1Q9NQ79 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRTAC1Q9NQ79 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CRTAC1Q9NQ79 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CRTAC1Q9NQ79 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRTAC1Q9NQ79 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRTAC1Q9NQ79 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms