Protein–RNA interactions for Protein: Q9H741

C12orf49, UPF0454 protein C12orf49, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf49Q9H741 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf49Q9H741 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf49Q9H741 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf49Q9H741 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf49Q9H741 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf49Q9H741 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C12orf49Q9H741 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C12orf49Q9H741 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf49Q9H741 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms