Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDT1Q9H211 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDT1Q9H211 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDT1Q9H211 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDT1Q9H211 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDT1Q9H211 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDT1Q9H211 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDT1Q9H211 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDT1Q9H211 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDT1Q9H211 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CDT1Q9H211 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDT1Q9H211 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDT1Q9H211 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDT1Q9H211 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDT1Q9H211 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms