Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR1Q9C0D0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHACTR1Q9C0D0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHACTR1Q9C0D0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHACTR1Q9C0D0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms