Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA9Q9BWV2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPATA9Q9BWV2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATA9Q9BWV2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPATA9Q9BWV2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPATA9Q9BWV2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPATA9Q9BWV2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPATA9Q9BWV2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms