Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRI1Q9BV20 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRI1Q9BV20 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRI1Q9BV20 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRI1Q9BV20 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms