Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBGCP3Q96CW5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBGCP3Q96CW5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBGCP3Q96CW5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP3Q96CW5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP3Q96CW5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179 ms