Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY07

SLC7A3, Cationic amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A3Q8WY07 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC7A3Q8WY07 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC7A3Q8WY07 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC7A3Q8WY07 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC7A3Q8WY07 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC7A3Q8WY07 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.7 ms