Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FSIP1Q8NA03 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FSIP1Q8NA03 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FSIP1Q8NA03 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FSIP1Q8NA03 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FSIP1Q8NA03 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FSIP1Q8NA03 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FSIP1Q8NA03 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FSIP1Q8NA03 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
FSIP1Q8NA03 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FSIP1Q8NA03 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FSIP1Q8NA03 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FSIP1Q8NA03 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms